Protein–RNA interactions for Protein: D3Z3L3

Trim12c, Tripartite motif-containing 12C, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim12cD3Z3L3 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim12cD3Z3L3 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim12cD3Z3L3 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim12cD3Z3L3 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim12cD3Z3L3 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim12cD3Z3L3 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim12cD3Z3L3 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim12cD3Z3L3 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trim12cD3Z3L3 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trim12cD3Z3L3 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trim12cD3Z3L3 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trim12cD3Z3L3 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trim12cD3Z3L3 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trim12cD3Z3L3 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trim12cD3Z3L3 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trim12cD3Z3L3 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trim12cD3Z3L3 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trim12cD3Z3L3 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trim12cD3Z3L3 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Trim12cD3Z3L3 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trim12cD3Z3L3 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trim12cD3Z3L3 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trim12cD3Z3L3 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trim12cD3Z3L3 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trim12cD3Z3L3 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Trim12cD3Z3L3 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trim12cD3Z3L3 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trim12cD3Z3L3 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trim12cD3Z3L3 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trim12cD3Z3L3 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trim12cD3Z3L3 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trim12cD3Z3L3 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trim12cD3Z3L3 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trim12cD3Z3L3 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trim12cD3Z3L3 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trim12cD3Z3L3 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trim12cD3Z3L3 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trim12cD3Z3L3 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trim12cD3Z3L3 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trim12cD3Z3L3 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trim12cD3Z3L3 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trim12cD3Z3L3 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trim12cD3Z3L3 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trim12cD3Z3L3 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trim12cD3Z3L3 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trim12cD3Z3L3 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Trim12cD3Z3L3 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trim12cD3Z3L3 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trim12cD3Z3L3 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trim12cD3Z3L3 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Trim12cD3Z3L3 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Trim12cD3Z3L3 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Trim12cD3Z3L3 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Trim12cD3Z3L3 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trim12cD3Z3L3 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trim12cD3Z3L3 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trim12cD3Z3L3 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trim12cD3Z3L3 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trim12cD3Z3L3 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trim12cD3Z3L3 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trim12cD3Z3L3 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trim12cD3Z3L3 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trim12cD3Z3L3 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Trim12cD3Z3L3 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trim12cD3Z3L3 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trim12cD3Z3L3 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trim12cD3Z3L3 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trim12cD3Z3L3 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trim12cD3Z3L3 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trim12cD3Z3L3 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trim12cD3Z3L3 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trim12cD3Z3L3 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trim12cD3Z3L3 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trim12cD3Z3L3 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trim12cD3Z3L3 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trim12cD3Z3L3 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trim12cD3Z3L3 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trim12cD3Z3L3 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Trim12cD3Z3L3 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trim12cD3Z3L3 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trim12cD3Z3L3 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trim12cD3Z3L3 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trim12cD3Z3L3 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trim12cD3Z3L3 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trim12cD3Z3L3 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trim12cD3Z3L3 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trim12cD3Z3L3 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trim12cD3Z3L3 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trim12cD3Z3L3 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trim12cD3Z3L3 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Trim12cD3Z3L3 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trim12cD3Z3L3 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trim12cD3Z3L3 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trim12cD3Z3L3 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Trim12cD3Z3L3 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Trim12cD3Z3L3 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Trim12cD3Z3L3 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Trim12cD3Z3L3 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Trim12cD3Z3L3 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Trim12cD3Z3L3 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms