Protein–RNA interactions for Protein: D3Z2H9

Tpm3-rs7, Tropomyosin 3, related sequence 7, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tpm3-rs7D3Z2H9 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.9 ms