Protein–RNA interactions for Protein: B2RXA7

Cyp26c1, Cytochrome P450, family 26, subfamily c, polypeptide 1, mousemouse

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp26c1B2RXA7 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cyp26c1B2RXA7 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cyp26c1B2RXA7 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cyp26c1B2RXA7 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cyp26c1B2RXA7 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cyp26c1B2RXA7 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cyp26c1B2RXA7 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cyp26c1B2RXA7 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cyp26c1B2RXA7 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cyp26c1B2RXA7 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Cyp26c1B2RXA7 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cyp26c1B2RXA7 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cyp26c1B2RXA7 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cyp26c1B2RXA7 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cyp26c1B2RXA7 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cyp26c1B2RXA7 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cyp26c1B2RXA7 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cyp26c1B2RXA7 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cyp26c1B2RXA7 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Cyp26c1B2RXA7 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Cyp26c1B2RXA7 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Cyp26c1B2RXA7 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cyp26c1B2RXA7 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cyp26c1B2RXA7 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cyp26c1B2RXA7 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cyp26c1B2RXA7 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cyp26c1B2RXA7 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cyp26c1B2RXA7 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cyp26c1B2RXA7 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cyp26c1B2RXA7 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cyp26c1B2RXA7 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cyp26c1B2RXA7 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Cyp26c1B2RXA7 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cyp26c1B2RXA7 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cyp26c1B2RXA7 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cyp26c1B2RXA7 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cyp26c1B2RXA7 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cyp26c1B2RXA7 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cyp26c1B2RXA7 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cyp26c1B2RXA7 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cyp26c1B2RXA7 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cyp26c1B2RXA7 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cyp26c1B2RXA7 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cyp26c1B2RXA7 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cyp26c1B2RXA7 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cyp26c1B2RXA7 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cyp26c1B2RXA7 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cyp26c1B2RXA7 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cyp26c1B2RXA7 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cyp26c1B2RXA7 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cyp26c1B2RXA7 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cyp26c1B2RXA7 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cyp26c1B2RXA7 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cyp26c1B2RXA7 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cyp26c1B2RXA7 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cyp26c1B2RXA7 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cyp26c1B2RXA7 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cyp26c1B2RXA7 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cyp26c1B2RXA7 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cyp26c1B2RXA7 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cyp26c1B2RXA7 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Cyp26c1B2RXA7 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cyp26c1B2RXA7 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cyp26c1B2RXA7 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Cyp26c1B2RXA7 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cyp26c1B2RXA7 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cyp26c1B2RXA7 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cyp26c1B2RXA7 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cyp26c1B2RXA7 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cyp26c1B2RXA7 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cyp26c1B2RXA7 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cyp26c1B2RXA7 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cyp26c1B2RXA7 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cyp26c1B2RXA7 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cyp26c1B2RXA7 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cyp26c1B2RXA7 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cyp26c1B2RXA7 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cyp26c1B2RXA7 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cyp26c1B2RXA7 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cyp26c1B2RXA7 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cyp26c1B2RXA7 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cyp26c1B2RXA7 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cyp26c1B2RXA7 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cyp26c1B2RXA7 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cyp26c1B2RXA7 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cyp26c1B2RXA7 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cyp26c1B2RXA7 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cyp26c1B2RXA7 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cyp26c1B2RXA7 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cyp26c1B2RXA7 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cyp26c1B2RXA7 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cyp26c1B2RXA7 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Cyp26c1B2RXA7 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cyp26c1B2RXA7 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Cyp26c1B2RXA7 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cyp26c1B2RXA7 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cyp26c1B2RXA7 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cyp26c1B2RXA7 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cyp26c1B2RXA7 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cyp26c1B2RXA7 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms