Protein–RNA interactions for Protein: B2RV38

Rd3l, BC048943 protein, mousemouse

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Length 197 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rd3lB2RV38 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rd3lB2RV38 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rd3lB2RV38 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rd3lB2RV38 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rd3lB2RV38 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rd3lB2RV38 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rd3lB2RV38 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rd3lB2RV38 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Rd3lB2RV38 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rd3lB2RV38 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rd3lB2RV38 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rd3lB2RV38 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rd3lB2RV38 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rd3lB2RV38 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rd3lB2RV38 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rd3lB2RV38 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rd3lB2RV38 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Rd3lB2RV38 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rd3lB2RV38 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rd3lB2RV38 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rd3lB2RV38 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rd3lB2RV38 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rd3lB2RV38 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rd3lB2RV38 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rd3lB2RV38 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rd3lB2RV38 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rd3lB2RV38 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rd3lB2RV38 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rd3lB2RV38 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rd3lB2RV38 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Rd3lB2RV38 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Rd3lB2RV38 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rd3lB2RV38 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rd3lB2RV38 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rd3lB2RV38 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rd3lB2RV38 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rd3lB2RV38 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rd3lB2RV38 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rd3lB2RV38 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rd3lB2RV38 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rd3lB2RV38 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rd3lB2RV38 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rd3lB2RV38 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rd3lB2RV38 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rd3lB2RV38 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Rd3lB2RV38 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rd3lB2RV38 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rd3lB2RV38 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rd3lB2RV38 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Rd3lB2RV38 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rd3lB2RV38 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rd3lB2RV38 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rd3lB2RV38 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rd3lB2RV38 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rd3lB2RV38 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rd3lB2RV38 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rd3lB2RV38 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rd3lB2RV38 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rd3lB2RV38 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rd3lB2RV38 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rd3lB2RV38 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rd3lB2RV38 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rd3lB2RV38 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rd3lB2RV38 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rd3lB2RV38 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rd3lB2RV38 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rd3lB2RV38 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rd3lB2RV38 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rd3lB2RV38 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rd3lB2RV38 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rd3lB2RV38 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rd3lB2RV38 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Rd3lB2RV38 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Rd3lB2RV38 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rd3lB2RV38 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rd3lB2RV38 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Rd3lB2RV38 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rd3lB2RV38 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rd3lB2RV38 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rd3lB2RV38 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rd3lB2RV38 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rd3lB2RV38 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rd3lB2RV38 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rd3lB2RV38 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rd3lB2RV38 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rd3lB2RV38 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rd3lB2RV38 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rd3lB2RV38 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rd3lB2RV38 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rd3lB2RV38 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rd3lB2RV38 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Rd3lB2RV38 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rd3lB2RV38 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rd3lB2RV38 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rd3lB2RV38 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rd3lB2RV38 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rd3lB2RV38 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rd3lB2RV38 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rd3lB2RV38 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rd3lB2RV38 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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