Protein–RNA interactions for Protein: B2RU40

Prrt4, Proline-rich transmembrane protein 4, mousemouse

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Length 902 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt4B2RU40 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prrt4B2RU40 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prrt4B2RU40 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prrt4B2RU40 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prrt4B2RU40 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prrt4B2RU40 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prrt4B2RU40 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prrt4B2RU40 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prrt4B2RU40 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prrt4B2RU40 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prrt4B2RU40 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prrt4B2RU40 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prrt4B2RU40 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prrt4B2RU40 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prrt4B2RU40 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prrt4B2RU40 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prrt4B2RU40 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prrt4B2RU40 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Prrt4B2RU40 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prrt4B2RU40 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prrt4B2RU40 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Prrt4B2RU40 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prrt4B2RU40 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prrt4B2RU40 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prrt4B2RU40 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prrt4B2RU40 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prrt4B2RU40 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prrt4B2RU40 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prrt4B2RU40 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prrt4B2RU40 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prrt4B2RU40 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prrt4B2RU40 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prrt4B2RU40 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prrt4B2RU40 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prrt4B2RU40 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prrt4B2RU40 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prrt4B2RU40 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Prrt4B2RU40 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Prrt4B2RU40 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Prrt4B2RU40 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Prrt4B2RU40 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Prrt4B2RU40 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Prrt4B2RU40 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Prrt4B2RU40 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Prrt4B2RU40 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Prrt4B2RU40 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Prrt4B2RU40 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Prrt4B2RU40 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Prrt4B2RU40 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Prrt4B2RU40 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Prrt4B2RU40 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Prrt4B2RU40 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Prrt4B2RU40 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Prrt4B2RU40 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Prrt4B2RU40 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Prrt4B2RU40 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Prrt4B2RU40 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Prrt4B2RU40 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Prrt4B2RU40 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Prrt4B2RU40 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Prrt4B2RU40 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Prrt4B2RU40 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Prrt4B2RU40 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Prrt4B2RU40 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Prrt4B2RU40 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Prrt4B2RU40 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Prrt4B2RU40 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Prrt4B2RU40 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Prrt4B2RU40 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Prrt4B2RU40 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Prrt4B2RU40 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Prrt4B2RU40 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Prrt4B2RU40 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Prrt4B2RU40 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Prrt4B2RU40 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Prrt4B2RU40 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Prrt4B2RU40 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Prrt4B2RU40 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Prrt4B2RU40 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Prrt4B2RU40 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Prrt4B2RU40 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Prrt4B2RU40 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Prrt4B2RU40 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Prrt4B2RU40 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Prrt4B2RU40 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Prrt4B2RU40 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Prrt4B2RU40 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Prrt4B2RU40 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Prrt4B2RU40 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Prrt4B2RU40 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Prrt4B2RU40 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Prrt4B2RU40 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Prrt4B2RU40 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Prrt4B2RU40 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Prrt4B2RU40 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Prrt4B2RU40 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Prrt4B2RU40 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Prrt4B2RU40 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Prrt4B2RU40 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Prrt4B2RU40 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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