Protein–RNA interactions for Protein: B2KF50

Uhrf1bp1, UHRF1 (ICBP90)-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf1bp1B2KF50 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Uhrf1bp1B2KF50 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Uhrf1bp1B2KF50 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Uhrf1bp1B2KF50 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Uhrf1bp1B2KF50 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Uhrf1bp1B2KF50 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Uhrf1bp1B2KF50 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Uhrf1bp1B2KF50 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Uhrf1bp1B2KF50 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Uhrf1bp1B2KF50 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Uhrf1bp1B2KF50 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Uhrf1bp1B2KF50 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Uhrf1bp1B2KF50 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Uhrf1bp1B2KF50 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Uhrf1bp1B2KF50 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Uhrf1bp1B2KF50 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Uhrf1bp1B2KF50 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Uhrf1bp1B2KF50 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Uhrf1bp1B2KF50 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Uhrf1bp1B2KF50 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Uhrf1bp1B2KF50 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Uhrf1bp1B2KF50 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Uhrf1bp1B2KF50 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Uhrf1bp1B2KF50 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Uhrf1bp1B2KF50 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Uhrf1bp1B2KF50 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Uhrf1bp1B2KF50 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Uhrf1bp1B2KF50 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Uhrf1bp1B2KF50 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Uhrf1bp1B2KF50 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Uhrf1bp1B2KF50 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Uhrf1bp1B2KF50 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Uhrf1bp1B2KF50 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Uhrf1bp1B2KF50 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Uhrf1bp1B2KF50 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Uhrf1bp1B2KF50 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Uhrf1bp1B2KF50 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Uhrf1bp1B2KF50 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Uhrf1bp1B2KF50 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Uhrf1bp1B2KF50 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Uhrf1bp1B2KF50 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Uhrf1bp1B2KF50 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Uhrf1bp1B2KF50 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Uhrf1bp1B2KF50 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Uhrf1bp1B2KF50 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Uhrf1bp1B2KF50 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Uhrf1bp1B2KF50 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Uhrf1bp1B2KF50 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Uhrf1bp1B2KF50 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Uhrf1bp1B2KF50 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Uhrf1bp1B2KF50 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Uhrf1bp1B2KF50 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Uhrf1bp1B2KF50 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Uhrf1bp1B2KF50 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Uhrf1bp1B2KF50 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Uhrf1bp1B2KF50 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Uhrf1bp1B2KF50 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Uhrf1bp1B2KF50 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Uhrf1bp1B2KF50 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Uhrf1bp1B2KF50 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Uhrf1bp1B2KF50 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Uhrf1bp1B2KF50 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Uhrf1bp1B2KF50 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Uhrf1bp1B2KF50 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Uhrf1bp1B2KF50 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Uhrf1bp1B2KF50 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Uhrf1bp1B2KF50 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Uhrf1bp1B2KF50 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Uhrf1bp1B2KF50 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Uhrf1bp1B2KF50 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Uhrf1bp1B2KF50 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Uhrf1bp1B2KF50 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Uhrf1bp1B2KF50 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Uhrf1bp1B2KF50 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Uhrf1bp1B2KF50 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Uhrf1bp1B2KF50 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Uhrf1bp1B2KF50 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Uhrf1bp1B2KF50 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Uhrf1bp1B2KF50 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Uhrf1bp1B2KF50 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Uhrf1bp1B2KF50 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Uhrf1bp1B2KF50 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Uhrf1bp1B2KF50 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Uhrf1bp1B2KF50 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Uhrf1bp1B2KF50 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Uhrf1bp1B2KF50 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Uhrf1bp1B2KF50 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Uhrf1bp1B2KF50 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Uhrf1bp1B2KF50 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Uhrf1bp1B2KF50 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Uhrf1bp1B2KF50 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Uhrf1bp1B2KF50 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Uhrf1bp1B2KF50 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Uhrf1bp1B2KF50 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Uhrf1bp1B2KF50 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Uhrf1bp1B2KF50 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Uhrf1bp1B2KF50 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Uhrf1bp1B2KF50 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Uhrf1bp1B2KF50 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Uhrf1bp1B2KF50 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms