Protein–RNA interactions for Protein: B2KF05

Brpf3, Bromodomain and PHD finger-containing, 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf3B2KF05 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Brpf3B2KF05 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Brpf3B2KF05 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Brpf3B2KF05 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Brpf3B2KF05 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Brpf3B2KF05 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Brpf3B2KF05 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Brpf3B2KF05 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Brpf3B2KF05 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Brpf3B2KF05 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Brpf3B2KF05 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Brpf3B2KF05 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Brpf3B2KF05 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Brpf3B2KF05 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Brpf3B2KF05 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Brpf3B2KF05 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Brpf3B2KF05 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Brpf3B2KF05 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Brpf3B2KF05 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Brpf3B2KF05 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Brpf3B2KF05 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Brpf3B2KF05 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Brpf3B2KF05 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Brpf3B2KF05 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Brpf3B2KF05 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Brpf3B2KF05 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Brpf3B2KF05 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Brpf3B2KF05 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Brpf3B2KF05 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Brpf3B2KF05 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Brpf3B2KF05 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Brpf3B2KF05 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Brpf3B2KF05 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Brpf3B2KF05 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Brpf3B2KF05 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Brpf3B2KF05 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Brpf3B2KF05 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Brpf3B2KF05 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Brpf3B2KF05 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Brpf3B2KF05 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Brpf3B2KF05 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Brpf3B2KF05 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Brpf3B2KF05 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Brpf3B2KF05 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Brpf3B2KF05 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Brpf3B2KF05 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Brpf3B2KF05 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Brpf3B2KF05 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Brpf3B2KF05 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Brpf3B2KF05 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Brpf3B2KF05 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Brpf3B2KF05 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Brpf3B2KF05 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Brpf3B2KF05 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Brpf3B2KF05 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Brpf3B2KF05 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Brpf3B2KF05 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Brpf3B2KF05 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Brpf3B2KF05 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Brpf3B2KF05 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Brpf3B2KF05 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Brpf3B2KF05 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Brpf3B2KF05 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Brpf3B2KF05 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Brpf3B2KF05 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Brpf3B2KF05 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Brpf3B2KF05 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Brpf3B2KF05 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Brpf3B2KF05 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Brpf3B2KF05 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Brpf3B2KF05 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Brpf3B2KF05 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Brpf3B2KF05 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Brpf3B2KF05 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Brpf3B2KF05 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Brpf3B2KF05 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Brpf3B2KF05 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Brpf3B2KF05 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Brpf3B2KF05 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Brpf3B2KF05 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Brpf3B2KF05 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Brpf3B2KF05 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Brpf3B2KF05 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Brpf3B2KF05 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Brpf3B2KF05 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Brpf3B2KF05 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Brpf3B2KF05 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Brpf3B2KF05 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Brpf3B2KF05 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Brpf3B2KF05 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Brpf3B2KF05 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Brpf3B2KF05 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Brpf3B2KF05 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Brpf3B2KF05 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Brpf3B2KF05 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Brpf3B2KF05 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Brpf3B2KF05 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Brpf3B2KF05 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Brpf3B2KF05 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Brpf3B2KF05 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms