Protein–RNA interactions for Protein: A6NAS3

Gm3173, Alpha6-takusan, mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3173A6NAS3 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm3173A6NAS3 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm3173A6NAS3 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm3173A6NAS3 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm3173A6NAS3 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm3173A6NAS3 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm3173A6NAS3 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm3173A6NAS3 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm3173A6NAS3 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm3173A6NAS3 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm3173A6NAS3 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm3173A6NAS3 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm3173A6NAS3 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm3173A6NAS3 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm3173A6NAS3 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm3173A6NAS3 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm3173A6NAS3 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm3173A6NAS3 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm3173A6NAS3 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm3173A6NAS3 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm3173A6NAS3 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm3173A6NAS3 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm3173A6NAS3 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm3173A6NAS3 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm3173A6NAS3 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm3173A6NAS3 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm3173A6NAS3 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm3173A6NAS3 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm3173A6NAS3 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm3173A6NAS3 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm3173A6NAS3 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm3173A6NAS3 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm3173A6NAS3 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm3173A6NAS3 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm3173A6NAS3 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm3173A6NAS3 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm3173A6NAS3 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm3173A6NAS3 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm3173A6NAS3 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm3173A6NAS3 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm3173A6NAS3 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm3173A6NAS3 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm3173A6NAS3 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm3173A6NAS3 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm3173A6NAS3 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm3173A6NAS3 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm3173A6NAS3 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm3173A6NAS3 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm3173A6NAS3 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm3173A6NAS3 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm3173A6NAS3 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm3173A6NAS3 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm3173A6NAS3 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm3173A6NAS3 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm3173A6NAS3 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm3173A6NAS3 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm3173A6NAS3 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm3173A6NAS3 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm3173A6NAS3 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm3173A6NAS3 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm3173A6NAS3 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm3173A6NAS3 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm3173A6NAS3 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm3173A6NAS3 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm3173A6NAS3 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm3173A6NAS3 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm3173A6NAS3 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm3173A6NAS3 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm3173A6NAS3 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm3173A6NAS3 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm3173A6NAS3 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm3173A6NAS3 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm3173A6NAS3 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm3173A6NAS3 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm3173A6NAS3 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm3173A6NAS3 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm3173A6NAS3 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm3173A6NAS3 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm3173A6NAS3 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm3173A6NAS3 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm3173A6NAS3 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm3173A6NAS3 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm3173A6NAS3 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm3173A6NAS3 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm3173A6NAS3 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm3173A6NAS3 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm3173A6NAS3 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm3173A6NAS3 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm3173A6NAS3 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm3173A6NAS3 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm3173A6NAS3 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm3173A6NAS3 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm3173A6NAS3 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm3173A6NAS3 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm3173A6NAS3 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm3173A6NAS3 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm3173A6NAS3 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm3173A6NAS3 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm3173A6NAS3 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm3173A6NAS3 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.7 ms