Protein–RNA interactions for Protein: A2APX8

Scn1a, Sodium channel protein type 1 subunit alpha, mousemouse

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Length 2,009 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn1aA2APX8 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Scn1aA2APX8 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scn1aA2APX8 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Scn1aA2APX8 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
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Scn1aA2APX8 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Scn1aA2APX8 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Scn1aA2APX8 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
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Scn1aA2APX8 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Scn1aA2APX8 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Scn1aA2APX8 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Scn1aA2APX8 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Scn1aA2APX8 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scn1aA2APX8 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scn1aA2APX8 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Scn1aA2APX8 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Scn1aA2APX8 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scn1aA2APX8 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scn1aA2APX8 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Scn1aA2APX8 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scn1aA2APX8 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scn1aA2APX8 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scn1aA2APX8 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scn1aA2APX8 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scn1aA2APX8 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scn1aA2APX8 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scn1aA2APX8 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scn1aA2APX8 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scn1aA2APX8 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scn1aA2APX8 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scn1aA2APX8 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scn1aA2APX8 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms