Protein–RNA interactions for Protein: A2APF3

Ctcfl, Transcriptional repressor CTCFL, mousemouse

Predictions only

Length 636 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtcflA2APF3 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CtcflA2APF3 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CtcflA2APF3 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CtcflA2APF3 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CtcflA2APF3 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CtcflA2APF3 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
CtcflA2APF3 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
CtcflA2APF3 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
CtcflA2APF3 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
CtcflA2APF3 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CtcflA2APF3 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
CtcflA2APF3 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC14□□□□□ -0.17
CtcflA2APF3 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
CtcflA2APF3 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CtcflA2APF3 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC14□□□□□ -0.17
CtcflA2APF3 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CtcflA2APF3 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CtcflA2APF3 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
CtcflA2APF3 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CtcflA2APF3 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CtcflA2APF3 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CtcflA2APF3 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CtcflA2APF3 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CtcflA2APF3 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CtcflA2APF3 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CtcflA2APF3 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
CtcflA2APF3 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CtcflA2APF3 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CtcflA2APF3 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CtcflA2APF3 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CtcflA2APF3 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CtcflA2APF3 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CtcflA2APF3 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CtcflA2APF3 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CtcflA2APF3 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CtcflA2APF3 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CtcflA2APF3 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CtcflA2APF3 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CtcflA2APF3 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CtcflA2APF3 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CtcflA2APF3 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CtcflA2APF3 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CtcflA2APF3 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CtcflA2APF3 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
CtcflA2APF3 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CtcflA2APF3 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CtcflA2APF3 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
CtcflA2APF3 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CtcflA2APF3 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CtcflA2APF3 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CtcflA2APF3 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CtcflA2APF3 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CtcflA2APF3 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CtcflA2APF3 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CtcflA2APF3 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CtcflA2APF3 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CtcflA2APF3 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CtcflA2APF3 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CtcflA2APF3 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CtcflA2APF3 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CtcflA2APF3 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CtcflA2APF3 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CtcflA2APF3 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CtcflA2APF3 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CtcflA2APF3 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CtcflA2APF3 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CtcflA2APF3 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CtcflA2APF3 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CtcflA2APF3 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CtcflA2APF3 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CtcflA2APF3 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CtcflA2APF3 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CtcflA2APF3 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CtcflA2APF3 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CtcflA2APF3 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CtcflA2APF3 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CtcflA2APF3 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CtcflA2APF3 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CtcflA2APF3 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CtcflA2APF3 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CtcflA2APF3 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CtcflA2APF3 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CtcflA2APF3 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CtcflA2APF3 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CtcflA2APF3 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CtcflA2APF3 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CtcflA2APF3 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CtcflA2APF3 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CtcflA2APF3 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CtcflA2APF3 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CtcflA2APF3 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CtcflA2APF3 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
CtcflA2APF3 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CtcflA2APF3 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CtcflA2APF3 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CtcflA2APF3 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
CtcflA2APF3 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CtcflA2APF3 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CtcflA2APF3 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CtcflA2APF3 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms