Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP6

Gm5538, MCG67716, mousemouse

Predictions only

Length 401 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5538W4VSP6 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm5538W4VSP6 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm5538W4VSP6 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm5538W4VSP6 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm5538W4VSP6 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm5538W4VSP6 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm5538W4VSP6 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Gm5538W4VSP6 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm5538W4VSP6 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm5538W4VSP6 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm5538W4VSP6 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm5538W4VSP6 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm5538W4VSP6 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm5538W4VSP6 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm5538W4VSP6 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm5538W4VSP6 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm5538W4VSP6 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm5538W4VSP6 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm5538W4VSP6 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm5538W4VSP6 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm5538W4VSP6 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm5538W4VSP6 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm5538W4VSP6 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm5538W4VSP6 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm5538W4VSP6 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm5538W4VSP6 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm5538W4VSP6 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm5538W4VSP6 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm5538W4VSP6 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm5538W4VSP6 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm5538W4VSP6 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm5538W4VSP6 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm5538W4VSP6 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm5538W4VSP6 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm5538W4VSP6 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm5538W4VSP6 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm5538W4VSP6 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm5538W4VSP6 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm5538W4VSP6 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm5538W4VSP6 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm5538W4VSP6 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm5538W4VSP6 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm5538W4VSP6 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm5538W4VSP6 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm5538W4VSP6 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm5538W4VSP6 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm5538W4VSP6 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm5538W4VSP6 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm5538W4VSP6 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm5538W4VSP6 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm5538W4VSP6 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm5538W4VSP6 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm5538W4VSP6 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm5538W4VSP6 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm5538W4VSP6 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm5538W4VSP6 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm5538W4VSP6 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm5538W4VSP6 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm5538W4VSP6 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm5538W4VSP6 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm5538W4VSP6 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm5538W4VSP6 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm5538W4VSP6 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm5538W4VSP6 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm5538W4VSP6 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm5538W4VSP6 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm5538W4VSP6 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm5538W4VSP6 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm5538W4VSP6 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm5538W4VSP6 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm5538W4VSP6 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm5538W4VSP6 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm5538W4VSP6 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm5538W4VSP6 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm5538W4VSP6 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm5538W4VSP6 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm5538W4VSP6 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm5538W4VSP6 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm5538W4VSP6 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm5538W4VSP6 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm5538W4VSP6 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm5538W4VSP6 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm5538W4VSP6 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm5538W4VSP6 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm5538W4VSP6 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm5538W4VSP6 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm5538W4VSP6 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm5538W4VSP6 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm5538W4VSP6 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm5538W4VSP6 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm5538W4VSP6 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm5538W4VSP6 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm5538W4VSP6 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm5538W4VSP6 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm5538W4VSP6 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm5538W4VSP6 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm5538W4VSP6 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm5538W4VSP6 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm5538W4VSP6 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm5538W4VSP6 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms