Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2D8

Mbd3, Methyl-CpG-binding domain protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd3Q9Z2D8 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Mbd3Q9Z2D8 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Mbd3Q9Z2D8 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Mbd3Q9Z2D8 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Mbd3Q9Z2D8 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Mbd3Q9Z2D8 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Mbd3Q9Z2D8 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Mbd3Q9Z2D8 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Mbd3Q9Z2D8 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Mbd3Q9Z2D8 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Mbd3Q9Z2D8 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Mbd3Q9Z2D8 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Mbd3Q9Z2D8 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Mbd3Q9Z2D8 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Mbd3Q9Z2D8 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Mbd3Q9Z2D8 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Mbd3Q9Z2D8 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Mbd3Q9Z2D8 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Mbd3Q9Z2D8 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Mbd3Q9Z2D8 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Mbd3Q9Z2D8 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Mbd3Q9Z2D8 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Mbd3Q9Z2D8 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Mbd3Q9Z2D8 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Mbd3Q9Z2D8 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Mbd3Q9Z2D8 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Mbd3Q9Z2D8 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Mbd3Q9Z2D8 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Mbd3Q9Z2D8 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Mbd3Q9Z2D8 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Mbd3Q9Z2D8 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Mbd3Q9Z2D8 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Mbd3Q9Z2D8 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Mbd3Q9Z2D8 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Mbd3Q9Z2D8 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Mbd3Q9Z2D8 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Mbd3Q9Z2D8 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Mbd3Q9Z2D8 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Mbd3Q9Z2D8 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Mbd3Q9Z2D8 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Mbd3Q9Z2D8 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Mbd3Q9Z2D8 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Mbd3Q9Z2D8 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Mbd3Q9Z2D8 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Mbd3Q9Z2D8 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Mbd3Q9Z2D8 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Mbd3Q9Z2D8 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Mbd3Q9Z2D8 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Mbd3Q9Z2D8 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Mbd3Q9Z2D8 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Mbd3Q9Z2D8 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Mbd3Q9Z2D8 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Mbd3Q9Z2D8 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Mbd3Q9Z2D8 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Mbd3Q9Z2D8 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Mbd3Q9Z2D8 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Mbd3Q9Z2D8 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Mbd3Q9Z2D8 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Mbd3Q9Z2D8 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Mbd3Q9Z2D8 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Mbd3Q9Z2D8 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Mbd3Q9Z2D8 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Mbd3Q9Z2D8 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Mbd3Q9Z2D8 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Mbd3Q9Z2D8 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Mbd3Q9Z2D8 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Mbd3Q9Z2D8 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Mbd3Q9Z2D8 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Mbd3Q9Z2D8 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Mbd3Q9Z2D8 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Mbd3Q9Z2D8 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Mbd3Q9Z2D8 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Mbd3Q9Z2D8 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Mbd3Q9Z2D8 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Mbd3Q9Z2D8 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Mbd3Q9Z2D8 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Mbd3Q9Z2D8 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Mbd3Q9Z2D8 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Mbd3Q9Z2D8 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Mbd3Q9Z2D8 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Mbd3Q9Z2D8 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Mbd3Q9Z2D8 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Mbd3Q9Z2D8 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Mbd3Q9Z2D8 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Mbd3Q9Z2D8 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Mbd3Q9Z2D8 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Mbd3Q9Z2D8 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Mbd3Q9Z2D8 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Mbd3Q9Z2D8 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Mbd3Q9Z2D8 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Mbd3Q9Z2D8 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Mbd3Q9Z2D8 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Mbd3Q9Z2D8 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Mbd3Q9Z2D8 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Mbd3Q9Z2D8 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Mbd3Q9Z2D8 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Mbd3Q9Z2D8 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Mbd3Q9Z2D8 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Mbd3Q9Z2D8 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Mbd3Q9Z2D8 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.9 ms