Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1T1

Ap3b1, AP-3 complex subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3b1Q9Z1T1 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ap3b1Q9Z1T1 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ap3b1Q9Z1T1 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ap3b1Q9Z1T1 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ap3b1Q9Z1T1 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Ap3b1Q9Z1T1 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ap3b1Q9Z1T1 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ap3b1Q9Z1T1 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Ap3b1Q9Z1T1 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Ap3b1Q9Z1T1 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ap3b1Q9Z1T1 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ap3b1Q9Z1T1 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ap3b1Q9Z1T1 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ap3b1Q9Z1T1 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Ap3b1Q9Z1T1 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ap3b1Q9Z1T1 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ap3b1Q9Z1T1 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ap3b1Q9Z1T1 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ap3b1Q9Z1T1 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ap3b1Q9Z1T1 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ap3b1Q9Z1T1 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ap3b1Q9Z1T1 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ap3b1Q9Z1T1 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Ap3b1Q9Z1T1 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Ap3b1Q9Z1T1 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Ap3b1Q9Z1T1 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ap3b1Q9Z1T1 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ap3b1Q9Z1T1 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ap3b1Q9Z1T1 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Ap3b1Q9Z1T1 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Ap3b1Q9Z1T1 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Ap3b1Q9Z1T1 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ap3b1Q9Z1T1 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ap3b1Q9Z1T1 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ap3b1Q9Z1T1 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ap3b1Q9Z1T1 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ap3b1Q9Z1T1 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ap3b1Q9Z1T1 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ap3b1Q9Z1T1 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ap3b1Q9Z1T1 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ap3b1Q9Z1T1 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ap3b1Q9Z1T1 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ap3b1Q9Z1T1 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ap3b1Q9Z1T1 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ap3b1Q9Z1T1 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Ap3b1Q9Z1T1 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ap3b1Q9Z1T1 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ap3b1Q9Z1T1 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ap3b1Q9Z1T1 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ap3b1Q9Z1T1 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ap3b1Q9Z1T1 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ap3b1Q9Z1T1 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ap3b1Q9Z1T1 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ap3b1Q9Z1T1 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ap3b1Q9Z1T1 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ap3b1Q9Z1T1 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ap3b1Q9Z1T1 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Ap3b1Q9Z1T1 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Ap3b1Q9Z1T1 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ap3b1Q9Z1T1 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ap3b1Q9Z1T1 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ap3b1Q9Z1T1 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ap3b1Q9Z1T1 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ap3b1Q9Z1T1 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ap3b1Q9Z1T1 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ap3b1Q9Z1T1 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ap3b1Q9Z1T1 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ap3b1Q9Z1T1 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ap3b1Q9Z1T1 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ap3b1Q9Z1T1 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ap3b1Q9Z1T1 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ap3b1Q9Z1T1 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ap3b1Q9Z1T1 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ap3b1Q9Z1T1 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ap3b1Q9Z1T1 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ap3b1Q9Z1T1 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ap3b1Q9Z1T1 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ap3b1Q9Z1T1 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ap3b1Q9Z1T1 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ap3b1Q9Z1T1 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ap3b1Q9Z1T1 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ap3b1Q9Z1T1 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ap3b1Q9Z1T1 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ap3b1Q9Z1T1 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ap3b1Q9Z1T1 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ap3b1Q9Z1T1 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ap3b1Q9Z1T1 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ap3b1Q9Z1T1 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ap3b1Q9Z1T1 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ap3b1Q9Z1T1 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ap3b1Q9Z1T1 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ap3b1Q9Z1T1 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ap3b1Q9Z1T1 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ap3b1Q9Z1T1 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ap3b1Q9Z1T1 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ap3b1Q9Z1T1 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ap3b1Q9Z1T1 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ap3b1Q9Z1T1 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Ap3b1Q9Z1T1 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ap3b1Q9Z1T1 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.7 ms