Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1Q9

Vars, Valine--tRNA ligase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VarsQ9Z1Q9 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
VarsQ9Z1Q9 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
VarsQ9Z1Q9 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
VarsQ9Z1Q9 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VarsQ9Z1Q9 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VarsQ9Z1Q9 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VarsQ9Z1Q9 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VarsQ9Z1Q9 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VarsQ9Z1Q9 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
VarsQ9Z1Q9 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
VarsQ9Z1Q9 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
VarsQ9Z1Q9 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
VarsQ9Z1Q9 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VarsQ9Z1Q9 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VarsQ9Z1Q9 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VarsQ9Z1Q9 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VarsQ9Z1Q9 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VarsQ9Z1Q9 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
VarsQ9Z1Q9 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VarsQ9Z1Q9 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VarsQ9Z1Q9 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VarsQ9Z1Q9 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VarsQ9Z1Q9 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
VarsQ9Z1Q9 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
VarsQ9Z1Q9 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
VarsQ9Z1Q9 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
VarsQ9Z1Q9 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
VarsQ9Z1Q9 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
VarsQ9Z1Q9 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
VarsQ9Z1Q9 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VarsQ9Z1Q9 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VarsQ9Z1Q9 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VarsQ9Z1Q9 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
VarsQ9Z1Q9 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VarsQ9Z1Q9 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
VarsQ9Z1Q9 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VarsQ9Z1Q9 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VarsQ9Z1Q9 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VarsQ9Z1Q9 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VarsQ9Z1Q9 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VarsQ9Z1Q9 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
VarsQ9Z1Q9 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VarsQ9Z1Q9 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VarsQ9Z1Q9 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VarsQ9Z1Q9 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VarsQ9Z1Q9 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
VarsQ9Z1Q9 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VarsQ9Z1Q9 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VarsQ9Z1Q9 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VarsQ9Z1Q9 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
VarsQ9Z1Q9 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VarsQ9Z1Q9 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VarsQ9Z1Q9 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VarsQ9Z1Q9 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VarsQ9Z1Q9 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VarsQ9Z1Q9 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VarsQ9Z1Q9 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
VarsQ9Z1Q9 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VarsQ9Z1Q9 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
VarsQ9Z1Q9 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
VarsQ9Z1Q9 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
VarsQ9Z1Q9 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VarsQ9Z1Q9 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
VarsQ9Z1Q9 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VarsQ9Z1Q9 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VarsQ9Z1Q9 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VarsQ9Z1Q9 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VarsQ9Z1Q9 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VarsQ9Z1Q9 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VarsQ9Z1Q9 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VarsQ9Z1Q9 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VarsQ9Z1Q9 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
VarsQ9Z1Q9 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VarsQ9Z1Q9 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VarsQ9Z1Q9 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
VarsQ9Z1Q9 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VarsQ9Z1Q9 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VarsQ9Z1Q9 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VarsQ9Z1Q9 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VarsQ9Z1Q9 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VarsQ9Z1Q9 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VarsQ9Z1Q9 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
VarsQ9Z1Q9 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VarsQ9Z1Q9 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
VarsQ9Z1Q9 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VarsQ9Z1Q9 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VarsQ9Z1Q9 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VarsQ9Z1Q9 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VarsQ9Z1Q9 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
VarsQ9Z1Q9 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
VarsQ9Z1Q9 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
VarsQ9Z1Q9 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VarsQ9Z1Q9 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
VarsQ9Z1Q9 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
VarsQ9Z1Q9 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VarsQ9Z1Q9 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VarsQ9Z1Q9 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VarsQ9Z1Q9 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VarsQ9Z1Q9 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VarsQ9Z1Q9 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms