Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1E3

Nfkbia, NF-kappa-B inhibitor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfkbiaQ9Z1E3 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
NfkbiaQ9Z1E3 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
NfkbiaQ9Z1E3 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
NfkbiaQ9Z1E3 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
NfkbiaQ9Z1E3 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
NfkbiaQ9Z1E3 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
NfkbiaQ9Z1E3 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
NfkbiaQ9Z1E3 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
NfkbiaQ9Z1E3 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
NfkbiaQ9Z1E3 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
NfkbiaQ9Z1E3 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
NfkbiaQ9Z1E3 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
NfkbiaQ9Z1E3 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
NfkbiaQ9Z1E3 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
NfkbiaQ9Z1E3 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
NfkbiaQ9Z1E3 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
NfkbiaQ9Z1E3 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
NfkbiaQ9Z1E3 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
NfkbiaQ9Z1E3 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
NfkbiaQ9Z1E3 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
NfkbiaQ9Z1E3 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
NfkbiaQ9Z1E3 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NfkbiaQ9Z1E3 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NfkbiaQ9Z1E3 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NfkbiaQ9Z1E3 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NfkbiaQ9Z1E3 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NfkbiaQ9Z1E3 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NfkbiaQ9Z1E3 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NfkbiaQ9Z1E3 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NfkbiaQ9Z1E3 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NfkbiaQ9Z1E3 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NfkbiaQ9Z1E3 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NfkbiaQ9Z1E3 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
NfkbiaQ9Z1E3 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
NfkbiaQ9Z1E3 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
NfkbiaQ9Z1E3 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
NfkbiaQ9Z1E3 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NfkbiaQ9Z1E3 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NfkbiaQ9Z1E3 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NfkbiaQ9Z1E3 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NfkbiaQ9Z1E3 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NfkbiaQ9Z1E3 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NfkbiaQ9Z1E3 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NfkbiaQ9Z1E3 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NfkbiaQ9Z1E3 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NfkbiaQ9Z1E3 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NfkbiaQ9Z1E3 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NfkbiaQ9Z1E3 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NfkbiaQ9Z1E3 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NfkbiaQ9Z1E3 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NfkbiaQ9Z1E3 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NfkbiaQ9Z1E3 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NfkbiaQ9Z1E3 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NfkbiaQ9Z1E3 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NfkbiaQ9Z1E3 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NfkbiaQ9Z1E3 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NfkbiaQ9Z1E3 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NfkbiaQ9Z1E3 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NfkbiaQ9Z1E3 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NfkbiaQ9Z1E3 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NfkbiaQ9Z1E3 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NfkbiaQ9Z1E3 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NfkbiaQ9Z1E3 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NfkbiaQ9Z1E3 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NfkbiaQ9Z1E3 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NfkbiaQ9Z1E3 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NfkbiaQ9Z1E3 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
NfkbiaQ9Z1E3 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
NfkbiaQ9Z1E3 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NfkbiaQ9Z1E3 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NfkbiaQ9Z1E3 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NfkbiaQ9Z1E3 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NfkbiaQ9Z1E3 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NfkbiaQ9Z1E3 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NfkbiaQ9Z1E3 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NfkbiaQ9Z1E3 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NfkbiaQ9Z1E3 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NfkbiaQ9Z1E3 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NfkbiaQ9Z1E3 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NfkbiaQ9Z1E3 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NfkbiaQ9Z1E3 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NfkbiaQ9Z1E3 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NfkbiaQ9Z1E3 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NfkbiaQ9Z1E3 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NfkbiaQ9Z1E3 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NfkbiaQ9Z1E3 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
NfkbiaQ9Z1E3 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NfkbiaQ9Z1E3 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NfkbiaQ9Z1E3 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NfkbiaQ9Z1E3 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
NfkbiaQ9Z1E3 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NfkbiaQ9Z1E3 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NfkbiaQ9Z1E3 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NfkbiaQ9Z1E3 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NfkbiaQ9Z1E3 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
NfkbiaQ9Z1E3 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NfkbiaQ9Z1E3 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NfkbiaQ9Z1E3 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NfkbiaQ9Z1E3 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NfkbiaQ9Z1E3 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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