Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z123

Sema4f, Semaphorin-4F, mousemouse

Predictions only

Length 777 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema4fQ9Z123 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sema4fQ9Z123 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sema4fQ9Z123 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sema4fQ9Z123 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sema4fQ9Z123 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sema4fQ9Z123 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sema4fQ9Z123 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sema4fQ9Z123 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Sema4fQ9Z123 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sema4fQ9Z123 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sema4fQ9Z123 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sema4fQ9Z123 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sema4fQ9Z123 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sema4fQ9Z123 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sema4fQ9Z123 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sema4fQ9Z123 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sema4fQ9Z123 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sema4fQ9Z123 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sema4fQ9Z123 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sema4fQ9Z123 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sema4fQ9Z123 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sema4fQ9Z123 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sema4fQ9Z123 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sema4fQ9Z123 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sema4fQ9Z123 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sema4fQ9Z123 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sema4fQ9Z123 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sema4fQ9Z123 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sema4fQ9Z123 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sema4fQ9Z123 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sema4fQ9Z123 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sema4fQ9Z123 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sema4fQ9Z123 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sema4fQ9Z123 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sema4fQ9Z123 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Sema4fQ9Z123 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sema4fQ9Z123 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Sema4fQ9Z123 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sema4fQ9Z123 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sema4fQ9Z123 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sema4fQ9Z123 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Sema4fQ9Z123 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sema4fQ9Z123 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sema4fQ9Z123 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sema4fQ9Z123 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sema4fQ9Z123 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sema4fQ9Z123 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sema4fQ9Z123 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sema4fQ9Z123 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Sema4fQ9Z123 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sema4fQ9Z123 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sema4fQ9Z123 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sema4fQ9Z123 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sema4fQ9Z123 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sema4fQ9Z123 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sema4fQ9Z123 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sema4fQ9Z123 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sema4fQ9Z123 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sema4fQ9Z123 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sema4fQ9Z123 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sema4fQ9Z123 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sema4fQ9Z123 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sema4fQ9Z123 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sema4fQ9Z123 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sema4fQ9Z123 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sema4fQ9Z123 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sema4fQ9Z123 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sema4fQ9Z123 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sema4fQ9Z123 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sema4fQ9Z123 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sema4fQ9Z123 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sema4fQ9Z123 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sema4fQ9Z123 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sema4fQ9Z123 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sema4fQ9Z123 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sema4fQ9Z123 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sema4fQ9Z123 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sema4fQ9Z123 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sema4fQ9Z123 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sema4fQ9Z123 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sema4fQ9Z123 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sema4fQ9Z123 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sema4fQ9Z123 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sema4fQ9Z123 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sema4fQ9Z123 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sema4fQ9Z123 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sema4fQ9Z123 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sema4fQ9Z123 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sema4fQ9Z123 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sema4fQ9Z123 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Sema4fQ9Z123 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sema4fQ9Z123 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sema4fQ9Z123 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sema4fQ9Z123 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sema4fQ9Z123 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sema4fQ9Z123 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sema4fQ9Z123 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sema4fQ9Z123 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sema4fQ9Z123 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sema4fQ9Z123 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms