Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0H8

Clip2, CAP-Gly domain-containing linker protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,047 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip2Q9Z0H8 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Clip2Q9Z0H8 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Clip2Q9Z0H8 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Clip2Q9Z0H8 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Clip2Q9Z0H8 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Clip2Q9Z0H8 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Clip2Q9Z0H8 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Clip2Q9Z0H8 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Clip2Q9Z0H8 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Clip2Q9Z0H8 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Clip2Q9Z0H8 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Clip2Q9Z0H8 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Clip2Q9Z0H8 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Clip2Q9Z0H8 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Clip2Q9Z0H8 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Clip2Q9Z0H8 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Clip2Q9Z0H8 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Clip2Q9Z0H8 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Clip2Q9Z0H8 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Clip2Q9Z0H8 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Clip2Q9Z0H8 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Clip2Q9Z0H8 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Clip2Q9Z0H8 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Clip2Q9Z0H8 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Clip2Q9Z0H8 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Clip2Q9Z0H8 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Clip2Q9Z0H8 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Clip2Q9Z0H8 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Clip2Q9Z0H8 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Clip2Q9Z0H8 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Clip2Q9Z0H8 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Clip2Q9Z0H8 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Clip2Q9Z0H8 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Clip2Q9Z0H8 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Clip2Q9Z0H8 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Clip2Q9Z0H8 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Clip2Q9Z0H8 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Clip2Q9Z0H8 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Clip2Q9Z0H8 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Clip2Q9Z0H8 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Clip2Q9Z0H8 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Clip2Q9Z0H8 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Clip2Q9Z0H8 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Clip2Q9Z0H8 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Clip2Q9Z0H8 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Clip2Q9Z0H8 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Clip2Q9Z0H8 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Clip2Q9Z0H8 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Clip2Q9Z0H8 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Clip2Q9Z0H8 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Clip2Q9Z0H8 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Clip2Q9Z0H8 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Clip2Q9Z0H8 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Clip2Q9Z0H8 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Clip2Q9Z0H8 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Clip2Q9Z0H8 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Clip2Q9Z0H8 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Clip2Q9Z0H8 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Clip2Q9Z0H8 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Clip2Q9Z0H8 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Clip2Q9Z0H8 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Clip2Q9Z0H8 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Clip2Q9Z0H8 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Clip2Q9Z0H8 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Clip2Q9Z0H8 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Clip2Q9Z0H8 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Clip2Q9Z0H8 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Clip2Q9Z0H8 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Clip2Q9Z0H8 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Clip2Q9Z0H8 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Clip2Q9Z0H8 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Clip2Q9Z0H8 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Clip2Q9Z0H8 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Clip2Q9Z0H8 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Clip2Q9Z0H8 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Clip2Q9Z0H8 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Clip2Q9Z0H8 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Clip2Q9Z0H8 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Clip2Q9Z0H8 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Clip2Q9Z0H8 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Clip2Q9Z0H8 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Clip2Q9Z0H8 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Clip2Q9Z0H8 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Clip2Q9Z0H8 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Clip2Q9Z0H8 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Clip2Q9Z0H8 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Clip2Q9Z0H8 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Clip2Q9Z0H8 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Clip2Q9Z0H8 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Clip2Q9Z0H8 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Clip2Q9Z0H8 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Clip2Q9Z0H8 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Clip2Q9Z0H8 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Clip2Q9Z0H8 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Clip2Q9Z0H8 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Clip2Q9Z0H8 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Clip2Q9Z0H8 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Clip2Q9Z0H8 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Clip2Q9Z0H8 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Clip2Q9Z0H8 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms