Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVF8

Tusc2, Tumor suppressor candidate 2, mousemouse

Predictions only

Length 110 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tusc2Q9WVF8 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tusc2Q9WVF8 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tusc2Q9WVF8 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tusc2Q9WVF8 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tusc2Q9WVF8 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tusc2Q9WVF8 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tusc2Q9WVF8 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tusc2Q9WVF8 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Tusc2Q9WVF8 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tusc2Q9WVF8 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tusc2Q9WVF8 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tusc2Q9WVF8 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tusc2Q9WVF8 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tusc2Q9WVF8 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tusc2Q9WVF8 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tusc2Q9WVF8 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tusc2Q9WVF8 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tusc2Q9WVF8 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tusc2Q9WVF8 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tusc2Q9WVF8 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tusc2Q9WVF8 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tusc2Q9WVF8 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tusc2Q9WVF8 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tusc2Q9WVF8 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tusc2Q9WVF8 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tusc2Q9WVF8 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tusc2Q9WVF8 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tusc2Q9WVF8 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tusc2Q9WVF8 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tusc2Q9WVF8 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tusc2Q9WVF8 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tusc2Q9WVF8 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Tusc2Q9WVF8 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tusc2Q9WVF8 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tusc2Q9WVF8 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tusc2Q9WVF8 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tusc2Q9WVF8 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tusc2Q9WVF8 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Tusc2Q9WVF8 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tusc2Q9WVF8 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tusc2Q9WVF8 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tusc2Q9WVF8 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tusc2Q9WVF8 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tusc2Q9WVF8 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tusc2Q9WVF8 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tusc2Q9WVF8 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tusc2Q9WVF8 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tusc2Q9WVF8 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tusc2Q9WVF8 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tusc2Q9WVF8 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tusc2Q9WVF8 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tusc2Q9WVF8 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tusc2Q9WVF8 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tusc2Q9WVF8 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tusc2Q9WVF8 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tusc2Q9WVF8 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tusc2Q9WVF8 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tusc2Q9WVF8 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tusc2Q9WVF8 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tusc2Q9WVF8 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tusc2Q9WVF8 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tusc2Q9WVF8 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tusc2Q9WVF8 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tusc2Q9WVF8 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tusc2Q9WVF8 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tusc2Q9WVF8 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Tusc2Q9WVF8 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tusc2Q9WVF8 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tusc2Q9WVF8 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tusc2Q9WVF8 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tusc2Q9WVF8 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tusc2Q9WVF8 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tusc2Q9WVF8 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tusc2Q9WVF8 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tusc2Q9WVF8 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tusc2Q9WVF8 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tusc2Q9WVF8 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tusc2Q9WVF8 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tusc2Q9WVF8 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tusc2Q9WVF8 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tusc2Q9WVF8 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tusc2Q9WVF8 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tusc2Q9WVF8 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tusc2Q9WVF8 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tusc2Q9WVF8 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tusc2Q9WVF8 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tusc2Q9WVF8 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tusc2Q9WVF8 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tusc2Q9WVF8 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tusc2Q9WVF8 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tusc2Q9WVF8 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tusc2Q9WVF8 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tusc2Q9WVF8 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tusc2Q9WVF8 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tusc2Q9WVF8 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tusc2Q9WVF8 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tusc2Q9WVF8 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tusc2Q9WVF8 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tusc2Q9WVF8 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tusc2Q9WVF8 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms