Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU38

Scnn1b, Amiloride-sensitive sodium channel subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scnn1bQ9WU38 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Scnn1bQ9WU38 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Scnn1bQ9WU38 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Scnn1bQ9WU38 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Scnn1bQ9WU38 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Scnn1bQ9WU38 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Scnn1bQ9WU38 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Scnn1bQ9WU38 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Scnn1bQ9WU38 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Scnn1bQ9WU38 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Scnn1bQ9WU38 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Scnn1bQ9WU38 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Scnn1bQ9WU38 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Scnn1bQ9WU38 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Scnn1bQ9WU38 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Scnn1bQ9WU38 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Scnn1bQ9WU38 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Scnn1bQ9WU38 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Scnn1bQ9WU38 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Scnn1bQ9WU38 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Scnn1bQ9WU38 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Scnn1bQ9WU38 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Scnn1bQ9WU38 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Scnn1bQ9WU38 Gm32877-201ENSMUST00000197419 709 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Scnn1bQ9WU38 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Scnn1bQ9WU38 Crisp4-201ENSMUST00000026876 1252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Scnn1bQ9WU38 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Scnn1bQ9WU38 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Scnn1bQ9WU38 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Scnn1bQ9WU38 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Scnn1bQ9WU38 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Scnn1bQ9WU38 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Scnn1bQ9WU38 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Scnn1bQ9WU38 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Scnn1bQ9WU38 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Scnn1bQ9WU38 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Scnn1bQ9WU38 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Scnn1bQ9WU38 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Scnn1bQ9WU38 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Scnn1bQ9WU38 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Scnn1bQ9WU38 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Scnn1bQ9WU38 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Scnn1bQ9WU38 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Scnn1bQ9WU38 Gm37436-201ENSMUST00000193842 1085 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Scnn1bQ9WU38 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Scnn1bQ9WU38 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Scnn1bQ9WU38 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Scnn1bQ9WU38 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Scnn1bQ9WU38 AC140209.1-201ENSMUST00000227875 284 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Scnn1bQ9WU38 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Scnn1bQ9WU38 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Scnn1bQ9WU38 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Scnn1bQ9WU38 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Scnn1bQ9WU38 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Scnn1bQ9WU38 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Scnn1bQ9WU38 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Scnn1bQ9WU38 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Scnn1bQ9WU38 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Scnn1bQ9WU38 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Scnn1bQ9WU38 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Scnn1bQ9WU38 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Scnn1bQ9WU38 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Scnn1bQ9WU38 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Scnn1bQ9WU38 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Scnn1bQ9WU38 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Scnn1bQ9WU38 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Scnn1bQ9WU38 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Scnn1bQ9WU38 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Scnn1bQ9WU38 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Scnn1bQ9WU38 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Scnn1bQ9WU38 Meig1-202ENSMUST00000115081 421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Scnn1bQ9WU38 Gm25509-201ENSMUST00000116985 106 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Scnn1bQ9WU38 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Scnn1bQ9WU38 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Scnn1bQ9WU38 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Scnn1bQ9WU38 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Scnn1bQ9WU38 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Scnn1bQ9WU38 4930513D17Rik-203ENSMUST00000202800 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Scnn1bQ9WU38 Gm43974-201ENSMUST00000205080 684 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Scnn1bQ9WU38 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Scnn1bQ9WU38 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Scnn1bQ9WU38 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Scnn1bQ9WU38 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Scnn1bQ9WU38 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Scnn1bQ9WU38 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Scnn1bQ9WU38 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Scnn1bQ9WU38 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Scnn1bQ9WU38 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Scnn1bQ9WU38 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Scnn1bQ9WU38 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Scnn1bQ9WU38 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Scnn1bQ9WU38 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Scnn1bQ9WU38 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Scnn1bQ9WU38 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Scnn1bQ9WU38 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Scnn1bQ9WU38 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Scnn1bQ9WU38 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Scnn1bQ9WU38 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Scnn1bQ9WU38 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Scnn1bQ9WU38 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms