Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU00

Nrf1, Nuclear respiratory factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrf1Q9WU00 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nrf1Q9WU00 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Nrf1Q9WU00 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
Nrf1Q9WU00 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Nrf1Q9WU00 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nrf1Q9WU00 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nrf1Q9WU00 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nrf1Q9WU00 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nrf1Q9WU00 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nrf1Q9WU00 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nrf1Q9WU00 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nrf1Q9WU00 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nrf1Q9WU00 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nrf1Q9WU00 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nrf1Q9WU00 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nrf1Q9WU00 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nrf1Q9WU00 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nrf1Q9WU00 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nrf1Q9WU00 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nrf1Q9WU00 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nrf1Q9WU00 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nrf1Q9WU00 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nrf1Q9WU00 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nrf1Q9WU00 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nrf1Q9WU00 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nrf1Q9WU00 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nrf1Q9WU00 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nrf1Q9WU00 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nrf1Q9WU00 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nrf1Q9WU00 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nrf1Q9WU00 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nrf1Q9WU00 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nrf1Q9WU00 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nrf1Q9WU00 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Nrf1Q9WU00 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nrf1Q9WU00 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nrf1Q9WU00 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nrf1Q9WU00 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nrf1Q9WU00 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nrf1Q9WU00 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nrf1Q9WU00 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nrf1Q9WU00 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nrf1Q9WU00 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nrf1Q9WU00 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nrf1Q9WU00 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nrf1Q9WU00 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nrf1Q9WU00 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nrf1Q9WU00 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nrf1Q9WU00 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nrf1Q9WU00 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nrf1Q9WU00 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nrf1Q9WU00 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Nrf1Q9WU00 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nrf1Q9WU00 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nrf1Q9WU00 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nrf1Q9WU00 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nrf1Q9WU00 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nrf1Q9WU00 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Nrf1Q9WU00 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Nrf1Q9WU00 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nrf1Q9WU00 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Nrf1Q9WU00 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nrf1Q9WU00 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nrf1Q9WU00 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nrf1Q9WU00 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nrf1Q9WU00 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nrf1Q9WU00 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nrf1Q9WU00 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Nrf1Q9WU00 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nrf1Q9WU00 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nrf1Q9WU00 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nrf1Q9WU00 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nrf1Q9WU00 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nrf1Q9WU00 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nrf1Q9WU00 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nrf1Q9WU00 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nrf1Q9WU00 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nrf1Q9WU00 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nrf1Q9WU00 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nrf1Q9WU00 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nrf1Q9WU00 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nrf1Q9WU00 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nrf1Q9WU00 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nrf1Q9WU00 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Nrf1Q9WU00 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nrf1Q9WU00 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nrf1Q9WU00 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nrf1Q9WU00 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nrf1Q9WU00 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nrf1Q9WU00 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nrf1Q9WU00 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nrf1Q9WU00 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nrf1Q9WU00 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nrf1Q9WU00 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nrf1Q9WU00 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nrf1Q9WU00 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nrf1Q9WU00 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nrf1Q9WU00 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nrf1Q9WU00 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nrf1Q9WU00 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms