Protein–RNA interactions for Protein: Q9R244

Trpc2, Short transient receptor potential channel 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc2Q9R244 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Trpc2Q9R244 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trpc2Q9R244 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trpc2Q9R244 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trpc2Q9R244 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trpc2Q9R244 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trpc2Q9R244 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trpc2Q9R244 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trpc2Q9R244 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trpc2Q9R244 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trpc2Q9R244 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trpc2Q9R244 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trpc2Q9R244 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trpc2Q9R244 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trpc2Q9R244 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trpc2Q9R244 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trpc2Q9R244 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trpc2Q9R244 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trpc2Q9R244 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trpc2Q9R244 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trpc2Q9R244 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trpc2Q9R244 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trpc2Q9R244 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trpc2Q9R244 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Trpc2Q9R244 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Trpc2Q9R244 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trpc2Q9R244 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trpc2Q9R244 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Trpc2Q9R244 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trpc2Q9R244 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trpc2Q9R244 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trpc2Q9R244 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trpc2Q9R244 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trpc2Q9R244 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trpc2Q9R244 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trpc2Q9R244 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trpc2Q9R244 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trpc2Q9R244 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trpc2Q9R244 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Trpc2Q9R244 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trpc2Q9R244 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Trpc2Q9R244 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Trpc2Q9R244 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trpc2Q9R244 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Trpc2Q9R244 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trpc2Q9R244 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trpc2Q9R244 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trpc2Q9R244 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trpc2Q9R244 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Trpc2Q9R244 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Trpc2Q9R244 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Trpc2Q9R244 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trpc2Q9R244 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trpc2Q9R244 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Trpc2Q9R244 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trpc2Q9R244 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trpc2Q9R244 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trpc2Q9R244 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trpc2Q9R244 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trpc2Q9R244 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Trpc2Q9R244 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trpc2Q9R244 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trpc2Q9R244 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trpc2Q9R244 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trpc2Q9R244 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trpc2Q9R244 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trpc2Q9R244 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trpc2Q9R244 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Trpc2Q9R244 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trpc2Q9R244 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trpc2Q9R244 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trpc2Q9R244 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trpc2Q9R244 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trpc2Q9R244 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trpc2Q9R244 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trpc2Q9R244 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trpc2Q9R244 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trpc2Q9R244 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trpc2Q9R244 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trpc2Q9R244 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trpc2Q9R244 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trpc2Q9R244 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trpc2Q9R244 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trpc2Q9R244 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trpc2Q9R244 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trpc2Q9R244 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trpc2Q9R244 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trpc2Q9R244 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trpc2Q9R244 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trpc2Q9R244 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trpc2Q9R244 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trpc2Q9R244 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trpc2Q9R244 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trpc2Q9R244 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trpc2Q9R244 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trpc2Q9R244 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trpc2Q9R244 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trpc2Q9R244 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trpc2Q9R244 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trpc2Q9R244 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms