Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS8

Sh2d3c, SH2 domain-containing protein 3C, mousemouse

Predictions only

Length 854 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh2d3cQ9QZS8 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Sh2d3cQ9QZS8 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Sh2d3cQ9QZS8 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sh2d3cQ9QZS8 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Sh2d3cQ9QZS8 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Sh2d3cQ9QZS8 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Sh2d3cQ9QZS8 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sh2d3cQ9QZS8 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Sh2d3cQ9QZS8 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sh2d3cQ9QZS8 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sh2d3cQ9QZS8 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sh2d3cQ9QZS8 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sh2d3cQ9QZS8 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sh2d3cQ9QZS8 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Sh2d3cQ9QZS8 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sh2d3cQ9QZS8 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sh2d3cQ9QZS8 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sh2d3cQ9QZS8 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sh2d3cQ9QZS8 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sh2d3cQ9QZS8 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sh2d3cQ9QZS8 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sh2d3cQ9QZS8 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sh2d3cQ9QZS8 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sh2d3cQ9QZS8 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sh2d3cQ9QZS8 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sh2d3cQ9QZS8 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sh2d3cQ9QZS8 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sh2d3cQ9QZS8 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sh2d3cQ9QZS8 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sh2d3cQ9QZS8 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sh2d3cQ9QZS8 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sh2d3cQ9QZS8 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Sh2d3cQ9QZS8 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sh2d3cQ9QZS8 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sh2d3cQ9QZS8 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Sh2d3cQ9QZS8 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sh2d3cQ9QZS8 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Sh2d3cQ9QZS8 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sh2d3cQ9QZS8 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sh2d3cQ9QZS8 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Sh2d3cQ9QZS8 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sh2d3cQ9QZS8 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Sh2d3cQ9QZS8 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sh2d3cQ9QZS8 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sh2d3cQ9QZS8 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sh2d3cQ9QZS8 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sh2d3cQ9QZS8 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sh2d3cQ9QZS8 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sh2d3cQ9QZS8 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sh2d3cQ9QZS8 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sh2d3cQ9QZS8 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Sh2d3cQ9QZS8 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sh2d3cQ9QZS8 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Sh2d3cQ9QZS8 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sh2d3cQ9QZS8 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sh2d3cQ9QZS8 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Sh2d3cQ9QZS8 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sh2d3cQ9QZS8 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sh2d3cQ9QZS8 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sh2d3cQ9QZS8 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Sh2d3cQ9QZS8 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sh2d3cQ9QZS8 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sh2d3cQ9QZS8 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Sh2d3cQ9QZS8 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sh2d3cQ9QZS8 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sh2d3cQ9QZS8 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Sh2d3cQ9QZS8 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Sh2d3cQ9QZS8 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Sh2d3cQ9QZS8 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Sh2d3cQ9QZS8 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Sh2d3cQ9QZS8 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Sh2d3cQ9QZS8 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Sh2d3cQ9QZS8 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Sh2d3cQ9QZS8 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Sh2d3cQ9QZS8 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Sh2d3cQ9QZS8 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Sh2d3cQ9QZS8 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Sh2d3cQ9QZS8 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Sh2d3cQ9QZS8 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Sh2d3cQ9QZS8 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Sh2d3cQ9QZS8 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sh2d3cQ9QZS8 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sh2d3cQ9QZS8 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sh2d3cQ9QZS8 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sh2d3cQ9QZS8 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sh2d3cQ9QZS8 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sh2d3cQ9QZS8 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sh2d3cQ9QZS8 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sh2d3cQ9QZS8 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Sh2d3cQ9QZS8 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Sh2d3cQ9QZS8 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sh2d3cQ9QZS8 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Sh2d3cQ9QZS8 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sh2d3cQ9QZS8 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sh2d3cQ9QZS8 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sh2d3cQ9QZS8 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sh2d3cQ9QZS8 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sh2d3cQ9QZS8 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sh2d3cQ9QZS8 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Sh2d3cQ9QZS8 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms