Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ88

Vps29, Vacuolar protein sorting-associated protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps29Q9QZ88 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vps29Q9QZ88 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vps29Q9QZ88 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Vps29Q9QZ88 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vps29Q9QZ88 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Vps29Q9QZ88 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Vps29Q9QZ88 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vps29Q9QZ88 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vps29Q9QZ88 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vps29Q9QZ88 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
Vps29Q9QZ88 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Vps29Q9QZ88 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Vps29Q9QZ88 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Vps29Q9QZ88 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Vps29Q9QZ88 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Vps29Q9QZ88 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Vps29Q9QZ88 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Vps29Q9QZ88 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vps29Q9QZ88 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vps29Q9QZ88 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vps29Q9QZ88 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vps29Q9QZ88 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vps29Q9QZ88 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vps29Q9QZ88 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vps29Q9QZ88 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vps29Q9QZ88 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vps29Q9QZ88 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vps29Q9QZ88 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vps29Q9QZ88 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vps29Q9QZ88 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Vps29Q9QZ88 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vps29Q9QZ88 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vps29Q9QZ88 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Vps29Q9QZ88 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vps29Q9QZ88 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vps29Q9QZ88 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vps29Q9QZ88 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vps29Q9QZ88 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vps29Q9QZ88 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vps29Q9QZ88 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vps29Q9QZ88 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vps29Q9QZ88 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vps29Q9QZ88 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vps29Q9QZ88 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vps29Q9QZ88 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vps29Q9QZ88 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vps29Q9QZ88 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vps29Q9QZ88 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vps29Q9QZ88 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vps29Q9QZ88 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vps29Q9QZ88 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vps29Q9QZ88 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vps29Q9QZ88 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vps29Q9QZ88 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vps29Q9QZ88 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Vps29Q9QZ88 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vps29Q9QZ88 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vps29Q9QZ88 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vps29Q9QZ88 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vps29Q9QZ88 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vps29Q9QZ88 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vps29Q9QZ88 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vps29Q9QZ88 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Vps29Q9QZ88 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vps29Q9QZ88 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vps29Q9QZ88 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vps29Q9QZ88 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vps29Q9QZ88 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Vps29Q9QZ88 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vps29Q9QZ88 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vps29Q9QZ88 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vps29Q9QZ88 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vps29Q9QZ88 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vps29Q9QZ88 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vps29Q9QZ88 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vps29Q9QZ88 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vps29Q9QZ88 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vps29Q9QZ88 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vps29Q9QZ88 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vps29Q9QZ88 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vps29Q9QZ88 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vps29Q9QZ88 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vps29Q9QZ88 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vps29Q9QZ88 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vps29Q9QZ88 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vps29Q9QZ88 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vps29Q9QZ88 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vps29Q9QZ88 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vps29Q9QZ88 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vps29Q9QZ88 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vps29Q9QZ88 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vps29Q9QZ88 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vps29Q9QZ88 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vps29Q9QZ88 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vps29Q9QZ88 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vps29Q9QZ88 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vps29Q9QZ88 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vps29Q9QZ88 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vps29Q9QZ88 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vps29Q9QZ88 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms