Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY76

Vapb, Vesicle-associated membrane protein-associated protein B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VapbQ9QY76 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
VapbQ9QY76 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
VapbQ9QY76 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
VapbQ9QY76 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
VapbQ9QY76 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
VapbQ9QY76 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
VapbQ9QY76 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
VapbQ9QY76 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
VapbQ9QY76 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
VapbQ9QY76 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
VapbQ9QY76 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
VapbQ9QY76 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
VapbQ9QY76 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
VapbQ9QY76 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
VapbQ9QY76 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
VapbQ9QY76 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
VapbQ9QY76 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
VapbQ9QY76 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
VapbQ9QY76 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
VapbQ9QY76 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
VapbQ9QY76 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
VapbQ9QY76 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
VapbQ9QY76 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
VapbQ9QY76 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
VapbQ9QY76 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
VapbQ9QY76 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
VapbQ9QY76 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
VapbQ9QY76 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
VapbQ9QY76 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
VapbQ9QY76 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
VapbQ9QY76 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
VapbQ9QY76 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
VapbQ9QY76 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
VapbQ9QY76 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
VapbQ9QY76 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
VapbQ9QY76 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
VapbQ9QY76 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
VapbQ9QY76 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
VapbQ9QY76 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
VapbQ9QY76 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
VapbQ9QY76 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
VapbQ9QY76 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
VapbQ9QY76 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
VapbQ9QY76 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
VapbQ9QY76 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
VapbQ9QY76 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
VapbQ9QY76 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
VapbQ9QY76 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
VapbQ9QY76 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
VapbQ9QY76 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
VapbQ9QY76 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
VapbQ9QY76 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
VapbQ9QY76 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
VapbQ9QY76 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
VapbQ9QY76 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
VapbQ9QY76 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
VapbQ9QY76 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
VapbQ9QY76 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
VapbQ9QY76 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
VapbQ9QY76 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
VapbQ9QY76 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
VapbQ9QY76 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
VapbQ9QY76 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
VapbQ9QY76 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
VapbQ9QY76 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
VapbQ9QY76 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
VapbQ9QY76 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
VapbQ9QY76 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
VapbQ9QY76 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
VapbQ9QY76 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
VapbQ9QY76 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
VapbQ9QY76 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
VapbQ9QY76 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
VapbQ9QY76 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
VapbQ9QY76 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
VapbQ9QY76 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
VapbQ9QY76 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
VapbQ9QY76 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
VapbQ9QY76 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
VapbQ9QY76 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
VapbQ9QY76 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
VapbQ9QY76 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
VapbQ9QY76 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
VapbQ9QY76 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
VapbQ9QY76 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
VapbQ9QY76 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
VapbQ9QY76 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
VapbQ9QY76 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
VapbQ9QY76 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
VapbQ9QY76 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
VapbQ9QY76 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
VapbQ9QY76 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
VapbQ9QY76 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
VapbQ9QY76 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
VapbQ9QY76 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
VapbQ9QY76 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
VapbQ9QY76 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
VapbQ9QY76 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
VapbQ9QY76 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
VapbQ9QY76 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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