Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXT9

Znf354b, Zinc finger protein 354B, mousemouse

Predictions only

Length 601 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf354bQ9QXT9 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Znf354bQ9QXT9 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Znf354bQ9QXT9 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Znf354bQ9QXT9 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Znf354bQ9QXT9 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Znf354bQ9QXT9 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Znf354bQ9QXT9 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Znf354bQ9QXT9 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Znf354bQ9QXT9 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Znf354bQ9QXT9 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Znf354bQ9QXT9 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Znf354bQ9QXT9 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Znf354bQ9QXT9 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Znf354bQ9QXT9 Gm12813-201ENSMUST00000119615 902 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Znf354bQ9QXT9 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Znf354bQ9QXT9 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Znf354bQ9QXT9 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Znf354bQ9QXT9 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Znf354bQ9QXT9 Gm28745-201ENSMUST00000190069 305 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Znf354bQ9QXT9 Gm31048-201ENSMUST00000196103 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Znf354bQ9QXT9 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Znf354bQ9QXT9 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Znf354bQ9QXT9 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Znf354bQ9QXT9 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Znf354bQ9QXT9 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Znf354bQ9QXT9 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Znf354bQ9QXT9 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Znf354bQ9QXT9 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Znf354bQ9QXT9 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Znf354bQ9QXT9 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Znf354bQ9QXT9 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Znf354bQ9QXT9 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Znf354bQ9QXT9 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Znf354bQ9QXT9 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Znf354bQ9QXT9 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Znf354bQ9QXT9 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Znf354bQ9QXT9 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Znf354bQ9QXT9 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Znf354bQ9QXT9 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Znf354bQ9QXT9 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Znf354bQ9QXT9 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Znf354bQ9QXT9 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Znf354bQ9QXT9 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Znf354bQ9QXT9 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Znf354bQ9QXT9 Gm9519-201ENSMUST00000206108 1337 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Znf354bQ9QXT9 Irf2-209ENSMUST00000210218 535 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Znf354bQ9QXT9 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Znf354bQ9QXT9 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Znf354bQ9QXT9 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Znf354bQ9QXT9 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Znf354bQ9QXT9 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Znf354bQ9QXT9 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Znf354bQ9QXT9 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Znf354bQ9QXT9 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Znf354bQ9QXT9 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Znf354bQ9QXT9 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Znf354bQ9QXT9 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Znf354bQ9QXT9 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Znf354bQ9QXT9 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Znf354bQ9QXT9 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Znf354bQ9QXT9 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Znf354bQ9QXT9 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Znf354bQ9QXT9 2610203C22Rik-201ENSMUST00000115480 1246 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Znf354bQ9QXT9 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Znf354bQ9QXT9 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Znf354bQ9QXT9 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Znf354bQ9QXT9 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Znf354bQ9QXT9 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Znf354bQ9QXT9 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Znf354bQ9QXT9 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Znf354bQ9QXT9 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Znf354bQ9QXT9 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Znf354bQ9QXT9 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Znf354bQ9QXT9 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Znf354bQ9QXT9 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Znf354bQ9QXT9 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Znf354bQ9QXT9 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Znf354bQ9QXT9 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Znf354bQ9QXT9 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Znf354bQ9QXT9 Gm37744-201ENSMUST00000194616 1590 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Znf354bQ9QXT9 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Znf354bQ9QXT9 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Znf354bQ9QXT9 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Znf354bQ9QXT9 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Znf354bQ9QXT9 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Znf354bQ9QXT9 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Znf354bQ9QXT9 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Znf354bQ9QXT9 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Znf354bQ9QXT9 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Znf354bQ9QXT9 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Znf354bQ9QXT9 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Znf354bQ9QXT9 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Znf354bQ9QXT9 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Znf354bQ9QXT9 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Znf354bQ9QXT9 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Znf354bQ9QXT9 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Znf354bQ9QXT9 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Znf354bQ9QXT9 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Znf354bQ9QXT9 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Znf354bQ9QXT9 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms