Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXG2

Chm, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 1, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChmQ9QXG2 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ChmQ9QXG2 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ChmQ9QXG2 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ChmQ9QXG2 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ChmQ9QXG2 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ChmQ9QXG2 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ChmQ9QXG2 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ChmQ9QXG2 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ChmQ9QXG2 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ChmQ9QXG2 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ChmQ9QXG2 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ChmQ9QXG2 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ChmQ9QXG2 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ChmQ9QXG2 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ChmQ9QXG2 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ChmQ9QXG2 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ChmQ9QXG2 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ChmQ9QXG2 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ChmQ9QXG2 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ChmQ9QXG2 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ChmQ9QXG2 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ChmQ9QXG2 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ChmQ9QXG2 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ChmQ9QXG2 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ChmQ9QXG2 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ChmQ9QXG2 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ChmQ9QXG2 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ChmQ9QXG2 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ChmQ9QXG2 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ChmQ9QXG2 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ChmQ9QXG2 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ChmQ9QXG2 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ChmQ9QXG2 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ChmQ9QXG2 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ChmQ9QXG2 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ChmQ9QXG2 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ChmQ9QXG2 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ChmQ9QXG2 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ChmQ9QXG2 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ChmQ9QXG2 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ChmQ9QXG2 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ChmQ9QXG2 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ChmQ9QXG2 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ChmQ9QXG2 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ChmQ9QXG2 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ChmQ9QXG2 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ChmQ9QXG2 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ChmQ9QXG2 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ChmQ9QXG2 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ChmQ9QXG2 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ChmQ9QXG2 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ChmQ9QXG2 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ChmQ9QXG2 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ChmQ9QXG2 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ChmQ9QXG2 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ChmQ9QXG2 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ChmQ9QXG2 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ChmQ9QXG2 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ChmQ9QXG2 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ChmQ9QXG2 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ChmQ9QXG2 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ChmQ9QXG2 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ChmQ9QXG2 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ChmQ9QXG2 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ChmQ9QXG2 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
ChmQ9QXG2 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ChmQ9QXG2 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ChmQ9QXG2 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
ChmQ9QXG2 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ChmQ9QXG2 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ChmQ9QXG2 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ChmQ9QXG2 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
ChmQ9QXG2 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
ChmQ9QXG2 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ChmQ9QXG2 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ChmQ9QXG2 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ChmQ9QXG2 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ChmQ9QXG2 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
ChmQ9QXG2 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ChmQ9QXG2 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
ChmQ9QXG2 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ChmQ9QXG2 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ChmQ9QXG2 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ChmQ9QXG2 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ChmQ9QXG2 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ChmQ9QXG2 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ChmQ9QXG2 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ChmQ9QXG2 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ChmQ9QXG2 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ChmQ9QXG2 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ChmQ9QXG2 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ChmQ9QXG2 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ChmQ9QXG2 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ChmQ9QXG2 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ChmQ9QXG2 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ChmQ9QXG2 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ChmQ9QXG2 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ChmQ9QXG2 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ChmQ9QXG2 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ChmQ9QXG2 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms