Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLG4

Pkd2l2, Polycystic kidney disease 2-like 2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2l2Q9JLG4 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pkd2l2Q9JLG4 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pkd2l2Q9JLG4 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pkd2l2Q9JLG4 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pkd2l2Q9JLG4 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pkd2l2Q9JLG4 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pkd2l2Q9JLG4 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pkd2l2Q9JLG4 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pkd2l2Q9JLG4 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Pkd2l2Q9JLG4 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pkd2l2Q9JLG4 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pkd2l2Q9JLG4 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pkd2l2Q9JLG4 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pkd2l2Q9JLG4 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pkd2l2Q9JLG4 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pkd2l2Q9JLG4 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pkd2l2Q9JLG4 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pkd2l2Q9JLG4 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pkd2l2Q9JLG4 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pkd2l2Q9JLG4 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pkd2l2Q9JLG4 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pkd2l2Q9JLG4 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pkd2l2Q9JLG4 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pkd2l2Q9JLG4 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pkd2l2Q9JLG4 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pkd2l2Q9JLG4 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pkd2l2Q9JLG4 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pkd2l2Q9JLG4 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pkd2l2Q9JLG4 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pkd2l2Q9JLG4 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pkd2l2Q9JLG4 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pkd2l2Q9JLG4 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pkd2l2Q9JLG4 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pkd2l2Q9JLG4 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Pkd2l2Q9JLG4 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Pkd2l2Q9JLG4 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pkd2l2Q9JLG4 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pkd2l2Q9JLG4 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pkd2l2Q9JLG4 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pkd2l2Q9JLG4 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pkd2l2Q9JLG4 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pkd2l2Q9JLG4 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pkd2l2Q9JLG4 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pkd2l2Q9JLG4 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pkd2l2Q9JLG4 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pkd2l2Q9JLG4 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pkd2l2Q9JLG4 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pkd2l2Q9JLG4 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pkd2l2Q9JLG4 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pkd2l2Q9JLG4 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pkd2l2Q9JLG4 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pkd2l2Q9JLG4 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pkd2l2Q9JLG4 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Pkd2l2Q9JLG4 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Pkd2l2Q9JLG4 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pkd2l2Q9JLG4 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Pkd2l2Q9JLG4 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pkd2l2Q9JLG4 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Pkd2l2Q9JLG4 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pkd2l2Q9JLG4 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pkd2l2Q9JLG4 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pkd2l2Q9JLG4 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pkd2l2Q9JLG4 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pkd2l2Q9JLG4 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pkd2l2Q9JLG4 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pkd2l2Q9JLG4 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pkd2l2Q9JLG4 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pkd2l2Q9JLG4 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pkd2l2Q9JLG4 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pkd2l2Q9JLG4 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pkd2l2Q9JLG4 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pkd2l2Q9JLG4 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pkd2l2Q9JLG4 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Pkd2l2Q9JLG4 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pkd2l2Q9JLG4 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Pkd2l2Q9JLG4 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Pkd2l2Q9JLG4 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pkd2l2Q9JLG4 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Pkd2l2Q9JLG4 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pkd2l2Q9JLG4 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Pkd2l2Q9JLG4 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pkd2l2Q9JLG4 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pkd2l2Q9JLG4 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pkd2l2Q9JLG4 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pkd2l2Q9JLG4 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pkd2l2Q9JLG4 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pkd2l2Q9JLG4 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pkd2l2Q9JLG4 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pkd2l2Q9JLG4 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pkd2l2Q9JLG4 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pkd2l2Q9JLG4 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pkd2l2Q9JLG4 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pkd2l2Q9JLG4 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pkd2l2Q9JLG4 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pkd2l2Q9JLG4 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pkd2l2Q9JLG4 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pkd2l2Q9JLG4 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pkd2l2Q9JLG4 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pkd2l2Q9JLG4 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pkd2l2Q9JLG4 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms