Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKS5

Habp4, Intracellular hyaluronan-binding protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Habp4Q9JKS5 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Habp4Q9JKS5 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Habp4Q9JKS5 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Habp4Q9JKS5 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Habp4Q9JKS5 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Habp4Q9JKS5 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Habp4Q9JKS5 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Habp4Q9JKS5 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Habp4Q9JKS5 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Habp4Q9JKS5 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Habp4Q9JKS5 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Habp4Q9JKS5 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Habp4Q9JKS5 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Habp4Q9JKS5 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Habp4Q9JKS5 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Habp4Q9JKS5 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Habp4Q9JKS5 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Habp4Q9JKS5 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Habp4Q9JKS5 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Habp4Q9JKS5 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Habp4Q9JKS5 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Habp4Q9JKS5 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Habp4Q9JKS5 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Habp4Q9JKS5 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Habp4Q9JKS5 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Habp4Q9JKS5 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Habp4Q9JKS5 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Habp4Q9JKS5 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Habp4Q9JKS5 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Habp4Q9JKS5 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Habp4Q9JKS5 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Habp4Q9JKS5 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Habp4Q9JKS5 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Habp4Q9JKS5 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Habp4Q9JKS5 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Habp4Q9JKS5 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Habp4Q9JKS5 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Habp4Q9JKS5 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Habp4Q9JKS5 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Habp4Q9JKS5 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Habp4Q9JKS5 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Habp4Q9JKS5 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Habp4Q9JKS5 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Habp4Q9JKS5 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Habp4Q9JKS5 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Habp4Q9JKS5 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Habp4Q9JKS5 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Habp4Q9JKS5 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Habp4Q9JKS5 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Habp4Q9JKS5 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Habp4Q9JKS5 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Habp4Q9JKS5 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Habp4Q9JKS5 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Habp4Q9JKS5 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Habp4Q9JKS5 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Habp4Q9JKS5 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Habp4Q9JKS5 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Habp4Q9JKS5 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Habp4Q9JKS5 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Habp4Q9JKS5 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Habp4Q9JKS5 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Habp4Q9JKS5 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Habp4Q9JKS5 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Habp4Q9JKS5 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Habp4Q9JKS5 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Habp4Q9JKS5 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Habp4Q9JKS5 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Habp4Q9JKS5 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Habp4Q9JKS5 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Habp4Q9JKS5 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Habp4Q9JKS5 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Habp4Q9JKS5 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Habp4Q9JKS5 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Habp4Q9JKS5 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Habp4Q9JKS5 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Habp4Q9JKS5 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Habp4Q9JKS5 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Habp4Q9JKS5 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Habp4Q9JKS5 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Habp4Q9JKS5 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Habp4Q9JKS5 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Habp4Q9JKS5 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Habp4Q9JKS5 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Habp4Q9JKS5 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Habp4Q9JKS5 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Habp4Q9JKS5 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Habp4Q9JKS5 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Habp4Q9JKS5 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Habp4Q9JKS5 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Habp4Q9JKS5 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Habp4Q9JKS5 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Habp4Q9JKS5 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Habp4Q9JKS5 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Habp4Q9JKS5 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Habp4Q9JKS5 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Habp4Q9JKS5 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Habp4Q9JKS5 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Habp4Q9JKS5 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Habp4Q9JKS5 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Habp4Q9JKS5 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms