Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJZ9

Cngb3, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cngb3Q9JJZ9 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cngb3Q9JJZ9 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cngb3Q9JJZ9 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cngb3Q9JJZ9 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cngb3Q9JJZ9 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cngb3Q9JJZ9 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cngb3Q9JJZ9 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cngb3Q9JJZ9 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cngb3Q9JJZ9 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cngb3Q9JJZ9 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cngb3Q9JJZ9 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cngb3Q9JJZ9 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cngb3Q9JJZ9 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cngb3Q9JJZ9 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cngb3Q9JJZ9 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cngb3Q9JJZ9 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cngb3Q9JJZ9 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cngb3Q9JJZ9 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cngb3Q9JJZ9 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cngb3Q9JJZ9 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cngb3Q9JJZ9 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cngb3Q9JJZ9 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cngb3Q9JJZ9 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cngb3Q9JJZ9 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cngb3Q9JJZ9 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cngb3Q9JJZ9 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cngb3Q9JJZ9 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cngb3Q9JJZ9 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cngb3Q9JJZ9 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cngb3Q9JJZ9 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cngb3Q9JJZ9 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cngb3Q9JJZ9 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cngb3Q9JJZ9 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cngb3Q9JJZ9 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cngb3Q9JJZ9 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cngb3Q9JJZ9 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cngb3Q9JJZ9 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cngb3Q9JJZ9 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cngb3Q9JJZ9 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cngb3Q9JJZ9 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cngb3Q9JJZ9 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cngb3Q9JJZ9 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cngb3Q9JJZ9 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cngb3Q9JJZ9 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cngb3Q9JJZ9 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cngb3Q9JJZ9 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cngb3Q9JJZ9 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cngb3Q9JJZ9 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cngb3Q9JJZ9 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cngb3Q9JJZ9 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cngb3Q9JJZ9 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cngb3Q9JJZ9 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cngb3Q9JJZ9 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cngb3Q9JJZ9 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cngb3Q9JJZ9 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Cngb3Q9JJZ9 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cngb3Q9JJZ9 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cngb3Q9JJZ9 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cngb3Q9JJZ9 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Cngb3Q9JJZ9 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Cngb3Q9JJZ9 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cngb3Q9JJZ9 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cngb3Q9JJZ9 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cngb3Q9JJZ9 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cngb3Q9JJZ9 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cngb3Q9JJZ9 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cngb3Q9JJZ9 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cngb3Q9JJZ9 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cngb3Q9JJZ9 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cngb3Q9JJZ9 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cngb3Q9JJZ9 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cngb3Q9JJZ9 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cngb3Q9JJZ9 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cngb3Q9JJZ9 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cngb3Q9JJZ9 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cngb3Q9JJZ9 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cngb3Q9JJZ9 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cngb3Q9JJZ9 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cngb3Q9JJZ9 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cngb3Q9JJZ9 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cngb3Q9JJZ9 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cngb3Q9JJZ9 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cngb3Q9JJZ9 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cngb3Q9JJZ9 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cngb3Q9JJZ9 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cngb3Q9JJZ9 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cngb3Q9JJZ9 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cngb3Q9JJZ9 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cngb3Q9JJZ9 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cngb3Q9JJZ9 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cngb3Q9JJZ9 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cngb3Q9JJZ9 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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