Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIW5

Smad9, Mothers against decapentaplegic homolog 9, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad9Q9JIW5 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smad9Q9JIW5 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smad9Q9JIW5 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smad9Q9JIW5 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Smad9Q9JIW5 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Smad9Q9JIW5 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smad9Q9JIW5 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smad9Q9JIW5 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smad9Q9JIW5 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smad9Q9JIW5 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smad9Q9JIW5 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smad9Q9JIW5 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smad9Q9JIW5 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smad9Q9JIW5 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smad9Q9JIW5 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smad9Q9JIW5 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smad9Q9JIW5 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smad9Q9JIW5 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Smad9Q9JIW5 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Smad9Q9JIW5 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Smad9Q9JIW5 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smad9Q9JIW5 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smad9Q9JIW5 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smad9Q9JIW5 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smad9Q9JIW5 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smad9Q9JIW5 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smad9Q9JIW5 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smad9Q9JIW5 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smad9Q9JIW5 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smad9Q9JIW5 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smad9Q9JIW5 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smad9Q9JIW5 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smad9Q9JIW5 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smad9Q9JIW5 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smad9Q9JIW5 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smad9Q9JIW5 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Smad9Q9JIW5 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smad9Q9JIW5 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smad9Q9JIW5 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smad9Q9JIW5 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smad9Q9JIW5 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smad9Q9JIW5 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smad9Q9JIW5 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smad9Q9JIW5 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smad9Q9JIW5 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smad9Q9JIW5 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smad9Q9JIW5 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smad9Q9JIW5 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smad9Q9JIW5 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smad9Q9JIW5 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smad9Q9JIW5 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Smad9Q9JIW5 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Smad9Q9JIW5 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smad9Q9JIW5 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smad9Q9JIW5 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smad9Q9JIW5 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smad9Q9JIW5 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smad9Q9JIW5 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smad9Q9JIW5 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smad9Q9JIW5 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smad9Q9JIW5 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smad9Q9JIW5 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smad9Q9JIW5 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smad9Q9JIW5 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smad9Q9JIW5 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smad9Q9JIW5 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smad9Q9JIW5 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smad9Q9JIW5 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smad9Q9JIW5 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smad9Q9JIW5 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smad9Q9JIW5 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smad9Q9JIW5 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Smad9Q9JIW5 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smad9Q9JIW5 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smad9Q9JIW5 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smad9Q9JIW5 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smad9Q9JIW5 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smad9Q9JIW5 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smad9Q9JIW5 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smad9Q9JIW5 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smad9Q9JIW5 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smad9Q9JIW5 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smad9Q9JIW5 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smad9Q9JIW5 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smad9Q9JIW5 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smad9Q9JIW5 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smad9Q9JIW5 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smad9Q9JIW5 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smad9Q9JIW5 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smad9Q9JIW5 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Smad9Q9JIW5 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smad9Q9JIW5 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Smad9Q9JIW5 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smad9Q9JIW5 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smad9Q9JIW5 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smad9Q9JIW5 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smad9Q9JIW5 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smad9Q9JIW5 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smad9Q9JIW5 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smad9Q9JIW5 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms