Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIG7

Ccdc22, Coiled-coil domain-containing protein 22, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc22Q9JIG7 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc22Q9JIG7 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc22Q9JIG7 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc22Q9JIG7 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc22Q9JIG7 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc22Q9JIG7 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc22Q9JIG7 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc22Q9JIG7 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc22Q9JIG7 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc22Q9JIG7 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc22Q9JIG7 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc22Q9JIG7 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc22Q9JIG7 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc22Q9JIG7 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc22Q9JIG7 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc22Q9JIG7 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc22Q9JIG7 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc22Q9JIG7 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc22Q9JIG7 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc22Q9JIG7 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc22Q9JIG7 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc22Q9JIG7 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc22Q9JIG7 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc22Q9JIG7 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc22Q9JIG7 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc22Q9JIG7 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc22Q9JIG7 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc22Q9JIG7 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc22Q9JIG7 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc22Q9JIG7 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc22Q9JIG7 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc22Q9JIG7 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc22Q9JIG7 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc22Q9JIG7 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc22Q9JIG7 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc22Q9JIG7 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc22Q9JIG7 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc22Q9JIG7 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc22Q9JIG7 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc22Q9JIG7 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc22Q9JIG7 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc22Q9JIG7 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc22Q9JIG7 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc22Q9JIG7 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc22Q9JIG7 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc22Q9JIG7 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc22Q9JIG7 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc22Q9JIG7 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc22Q9JIG7 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc22Q9JIG7 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc22Q9JIG7 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc22Q9JIG7 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc22Q9JIG7 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc22Q9JIG7 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc22Q9JIG7 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc22Q9JIG7 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc22Q9JIG7 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc22Q9JIG7 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc22Q9JIG7 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc22Q9JIG7 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc22Q9JIG7 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc22Q9JIG7 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc22Q9JIG7 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc22Q9JIG7 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc22Q9JIG7 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc22Q9JIG7 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc22Q9JIG7 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc22Q9JIG7 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc22Q9JIG7 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc22Q9JIG7 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc22Q9JIG7 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc22Q9JIG7 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc22Q9JIG7 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc22Q9JIG7 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc22Q9JIG7 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc22Q9JIG7 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc22Q9JIG7 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc22Q9JIG7 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc22Q9JIG7 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc22Q9JIG7 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc22Q9JIG7 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc22Q9JIG7 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc22Q9JIG7 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc22Q9JIG7 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc22Q9JIG7 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc22Q9JIG7 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc22Q9JIG7 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc22Q9JIG7 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc22Q9JIG7 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc22Q9JIG7 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc22Q9JIG7 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc22Q9JIG7 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc22Q9JIG7 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc22Q9JIG7 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc22Q9JIG7 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc22Q9JIG7 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc22Q9JIG7 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc22Q9JIG7 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc22Q9JIG7 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc22Q9JIG7 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms