Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESW8

Pgpep1, Pyroglutamyl-peptidase 1, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pgpep1Q9ESW8 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pgpep1Q9ESW8 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pgpep1Q9ESW8 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pgpep1Q9ESW8 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pgpep1Q9ESW8 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Pgpep1Q9ESW8 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pgpep1Q9ESW8 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pgpep1Q9ESW8 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pgpep1Q9ESW8 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pgpep1Q9ESW8 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pgpep1Q9ESW8 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pgpep1Q9ESW8 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pgpep1Q9ESW8 Gm38114-201ENSMUST00000191877 1232 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Pgpep1Q9ESW8 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pgpep1Q9ESW8 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pgpep1Q9ESW8 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pgpep1Q9ESW8 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pgpep1Q9ESW8 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pgpep1Q9ESW8 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pgpep1Q9ESW8 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pgpep1Q9ESW8 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pgpep1Q9ESW8 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pgpep1Q9ESW8 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pgpep1Q9ESW8 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pgpep1Q9ESW8 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pgpep1Q9ESW8 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pgpep1Q9ESW8 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pgpep1Q9ESW8 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pgpep1Q9ESW8 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pgpep1Q9ESW8 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pgpep1Q9ESW8 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Pgpep1Q9ESW8 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Pgpep1Q9ESW8 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Pgpep1Q9ESW8 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Pgpep1Q9ESW8 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Pgpep1Q9ESW8 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Pgpep1Q9ESW8 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Pgpep1Q9ESW8 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Pgpep1Q9ESW8 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Pgpep1Q9ESW8 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Pgpep1Q9ESW8 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Pgpep1Q9ESW8 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Pgpep1Q9ESW8 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Pgpep1Q9ESW8 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Pgpep1Q9ESW8 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Pgpep1Q9ESW8 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Pgpep1Q9ESW8 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Pgpep1Q9ESW8 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Pgpep1Q9ESW8 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Pgpep1Q9ESW8 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Pgpep1Q9ESW8 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Pgpep1Q9ESW8 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Pgpep1Q9ESW8 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Pgpep1Q9ESW8 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Pgpep1Q9ESW8 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Pgpep1Q9ESW8 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Pgpep1Q9ESW8 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Pgpep1Q9ESW8 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Pgpep1Q9ESW8 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Pgpep1Q9ESW8 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Pgpep1Q9ESW8 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Pgpep1Q9ESW8 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Pgpep1Q9ESW8 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Pgpep1Q9ESW8 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Pgpep1Q9ESW8 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Pgpep1Q9ESW8 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Pgpep1Q9ESW8 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Pgpep1Q9ESW8 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Pgpep1Q9ESW8 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Pgpep1Q9ESW8 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Pgpep1Q9ESW8 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Pgpep1Q9ESW8 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Pgpep1Q9ESW8 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Pgpep1Q9ESW8 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Pgpep1Q9ESW8 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Pgpep1Q9ESW8 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Pgpep1Q9ESW8 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Pgpep1Q9ESW8 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Pgpep1Q9ESW8 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Pgpep1Q9ESW8 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Pgpep1Q9ESW8 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pgpep1Q9ESW8 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pgpep1Q9ESW8 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pgpep1Q9ESW8 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pgpep1Q9ESW8 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pgpep1Q9ESW8 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pgpep1Q9ESW8 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pgpep1Q9ESW8 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pgpep1Q9ESW8 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Pgpep1Q9ESW8 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pgpep1Q9ESW8 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pgpep1Q9ESW8 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pgpep1Q9ESW8 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pgpep1Q9ESW8 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pgpep1Q9ESW8 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pgpep1Q9ESW8 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pgpep1Q9ESW8 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pgpep1Q9ESW8 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pgpep1Q9ESW8 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Pgpep1Q9ESW8 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms