Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESF1

Otof, Otoferlin, mousemouse

Predictions only

Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtofQ9ESF1 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
OtofQ9ESF1 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
OtofQ9ESF1 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
OtofQ9ESF1 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
OtofQ9ESF1 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
OtofQ9ESF1 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
OtofQ9ESF1 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
OtofQ9ESF1 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
OtofQ9ESF1 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
OtofQ9ESF1 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
OtofQ9ESF1 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
OtofQ9ESF1 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
OtofQ9ESF1 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
OtofQ9ESF1 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
OtofQ9ESF1 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
OtofQ9ESF1 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
OtofQ9ESF1 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
OtofQ9ESF1 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
OtofQ9ESF1 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
OtofQ9ESF1 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
OtofQ9ESF1 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
OtofQ9ESF1 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
OtofQ9ESF1 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
OtofQ9ESF1 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
OtofQ9ESF1 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
OtofQ9ESF1 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
OtofQ9ESF1 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
OtofQ9ESF1 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
OtofQ9ESF1 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
OtofQ9ESF1 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
OtofQ9ESF1 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
OtofQ9ESF1 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
OtofQ9ESF1 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
OtofQ9ESF1 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
OtofQ9ESF1 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
OtofQ9ESF1 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
OtofQ9ESF1 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
OtofQ9ESF1 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
OtofQ9ESF1 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
OtofQ9ESF1 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
OtofQ9ESF1 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
OtofQ9ESF1 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
OtofQ9ESF1 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
OtofQ9ESF1 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
OtofQ9ESF1 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
OtofQ9ESF1 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
OtofQ9ESF1 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
OtofQ9ESF1 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
OtofQ9ESF1 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
OtofQ9ESF1 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
OtofQ9ESF1 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
OtofQ9ESF1 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
OtofQ9ESF1 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
OtofQ9ESF1 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
OtofQ9ESF1 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
OtofQ9ESF1 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
OtofQ9ESF1 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
OtofQ9ESF1 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
OtofQ9ESF1 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
OtofQ9ESF1 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
OtofQ9ESF1 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
OtofQ9ESF1 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
OtofQ9ESF1 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
OtofQ9ESF1 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
OtofQ9ESF1 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
OtofQ9ESF1 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
OtofQ9ESF1 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
OtofQ9ESF1 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
OtofQ9ESF1 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
OtofQ9ESF1 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
OtofQ9ESF1 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
OtofQ9ESF1 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
OtofQ9ESF1 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
OtofQ9ESF1 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
OtofQ9ESF1 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
OtofQ9ESF1 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
OtofQ9ESF1 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
OtofQ9ESF1 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
OtofQ9ESF1 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
OtofQ9ESF1 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
OtofQ9ESF1 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
OtofQ9ESF1 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
OtofQ9ESF1 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
OtofQ9ESF1 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
OtofQ9ESF1 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
OtofQ9ESF1 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
OtofQ9ESF1 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
OtofQ9ESF1 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
OtofQ9ESF1 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
OtofQ9ESF1 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
OtofQ9ESF1 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
OtofQ9ESF1 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
OtofQ9ESF1 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
OtofQ9ESF1 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
OtofQ9ESF1 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
OtofQ9ESF1 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
OtofQ9ESF1 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
OtofQ9ESF1 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
OtofQ9ESF1 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
OtofQ9ESF1 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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