Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER71

Rhoj, Rho-related GTP-binding protein RhoJ, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhojQ9ER71 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RhojQ9ER71 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RhojQ9ER71 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RhojQ9ER71 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RhojQ9ER71 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RhojQ9ER71 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RhojQ9ER71 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RhojQ9ER71 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RhojQ9ER71 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RhojQ9ER71 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RhojQ9ER71 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RhojQ9ER71 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RhojQ9ER71 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RhojQ9ER71 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RhojQ9ER71 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RhojQ9ER71 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RhojQ9ER71 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RhojQ9ER71 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RhojQ9ER71 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RhojQ9ER71 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RhojQ9ER71 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RhojQ9ER71 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RhojQ9ER71 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RhojQ9ER71 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RhojQ9ER71 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RhojQ9ER71 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RhojQ9ER71 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RhojQ9ER71 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RhojQ9ER71 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RhojQ9ER71 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
RhojQ9ER71 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RhojQ9ER71 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RhojQ9ER71 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RhojQ9ER71 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RhojQ9ER71 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RhojQ9ER71 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RhojQ9ER71 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RhojQ9ER71 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RhojQ9ER71 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RhojQ9ER71 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RhojQ9ER71 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RhojQ9ER71 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RhojQ9ER71 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RhojQ9ER71 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
RhojQ9ER71 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RhojQ9ER71 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RhojQ9ER71 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RhojQ9ER71 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RhojQ9ER71 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RhojQ9ER71 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RhojQ9ER71 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RhojQ9ER71 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RhojQ9ER71 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RhojQ9ER71 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RhojQ9ER71 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
RhojQ9ER71 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
RhojQ9ER71 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
RhojQ9ER71 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
RhojQ9ER71 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RhojQ9ER71 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RhojQ9ER71 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RhojQ9ER71 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RhojQ9ER71 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RhojQ9ER71 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RhojQ9ER71 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
RhojQ9ER71 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RhojQ9ER71 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RhojQ9ER71 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RhojQ9ER71 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RhojQ9ER71 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RhojQ9ER71 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RhojQ9ER71 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RhojQ9ER71 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RhojQ9ER71 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RhojQ9ER71 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RhojQ9ER71 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RhojQ9ER71 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RhojQ9ER71 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RhojQ9ER71 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RhojQ9ER71 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RhojQ9ER71 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RhojQ9ER71 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RhojQ9ER71 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RhojQ9ER71 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RhojQ9ER71 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RhojQ9ER71 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RhojQ9ER71 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RhojQ9ER71 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RhojQ9ER71 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RhojQ9ER71 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RhojQ9ER71 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RhojQ9ER71 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RhojQ9ER71 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RhojQ9ER71 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RhojQ9ER71 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RhojQ9ER71 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
RhojQ9ER71 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RhojQ9ER71 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RhojQ9ER71 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RhojQ9ER71 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms