Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER63

Tnfrsf23, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 23, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf23Q9ER63 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tnfrsf23Q9ER63 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tnfrsf23Q9ER63 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tnfrsf23Q9ER63 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tnfrsf23Q9ER63 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tnfrsf23Q9ER63 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tnfrsf23Q9ER63 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tnfrsf23Q9ER63 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Tnfrsf23Q9ER63 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tnfrsf23Q9ER63 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tnfrsf23Q9ER63 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tnfrsf23Q9ER63 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tnfrsf23Q9ER63 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tnfrsf23Q9ER63 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tnfrsf23Q9ER63 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tnfrsf23Q9ER63 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tnfrsf23Q9ER63 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tnfrsf23Q9ER63 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tnfrsf23Q9ER63 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Tnfrsf23Q9ER63 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tnfrsf23Q9ER63 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tnfrsf23Q9ER63 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tnfrsf23Q9ER63 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tnfrsf23Q9ER63 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Tnfrsf23Q9ER63 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tnfrsf23Q9ER63 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tnfrsf23Q9ER63 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tnfrsf23Q9ER63 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tnfrsf23Q9ER63 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tnfrsf23Q9ER63 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tnfrsf23Q9ER63 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tnfrsf23Q9ER63 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tnfrsf23Q9ER63 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tnfrsf23Q9ER63 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Tnfrsf23Q9ER63 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tnfrsf23Q9ER63 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tnfrsf23Q9ER63 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tnfrsf23Q9ER63 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tnfrsf23Q9ER63 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tnfrsf23Q9ER63 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tnfrsf23Q9ER63 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tnfrsf23Q9ER63 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tnfrsf23Q9ER63 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tnfrsf23Q9ER63 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tnfrsf23Q9ER63 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tnfrsf23Q9ER63 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tnfrsf23Q9ER63 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tnfrsf23Q9ER63 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tnfrsf23Q9ER63 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tnfrsf23Q9ER63 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tnfrsf23Q9ER63 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tnfrsf23Q9ER63 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tnfrsf23Q9ER63 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tnfrsf23Q9ER63 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tnfrsf23Q9ER63 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tnfrsf23Q9ER63 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tnfrsf23Q9ER63 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tnfrsf23Q9ER63 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tnfrsf23Q9ER63 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tnfrsf23Q9ER63 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tnfrsf23Q9ER63 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tnfrsf23Q9ER63 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tnfrsf23Q9ER63 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tnfrsf23Q9ER63 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tnfrsf23Q9ER63 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tnfrsf23Q9ER63 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Tnfrsf23Q9ER63 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tnfrsf23Q9ER63 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tnfrsf23Q9ER63 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Tnfrsf23Q9ER63 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Tnfrsf23Q9ER63 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Tnfrsf23Q9ER63 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Tnfrsf23Q9ER63 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tnfrsf23Q9ER63 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tnfrsf23Q9ER63 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Tnfrsf23Q9ER63 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tnfrsf23Q9ER63 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tnfrsf23Q9ER63 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tnfrsf23Q9ER63 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Tnfrsf23Q9ER63 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tnfrsf23Q9ER63 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tnfrsf23Q9ER63 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tnfrsf23Q9ER63 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tnfrsf23Q9ER63 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tnfrsf23Q9ER63 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tnfrsf23Q9ER63 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tnfrsf23Q9ER63 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tnfrsf23Q9ER63 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tnfrsf23Q9ER63 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Tnfrsf23Q9ER63 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Tnfrsf23Q9ER63 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Tnfrsf23Q9ER63 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tnfrsf23Q9ER63 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tnfrsf23Q9ER63 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tnfrsf23Q9ER63 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tnfrsf23Q9ER63 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tnfrsf23Q9ER63 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tnfrsf23Q9ER63 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tnfrsf23Q9ER63 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tnfrsf23Q9ER63 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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