Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPK6

Sil1, Nucleotide exchange factor SIL1, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sil1Q9EPK6 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sil1Q9EPK6 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sil1Q9EPK6 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sil1Q9EPK6 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Sil1Q9EPK6 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sil1Q9EPK6 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sil1Q9EPK6 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sil1Q9EPK6 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sil1Q9EPK6 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sil1Q9EPK6 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sil1Q9EPK6 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sil1Q9EPK6 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sil1Q9EPK6 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sil1Q9EPK6 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sil1Q9EPK6 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sil1Q9EPK6 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sil1Q9EPK6 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sil1Q9EPK6 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sil1Q9EPK6 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sil1Q9EPK6 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sil1Q9EPK6 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sil1Q9EPK6 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Sil1Q9EPK6 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sil1Q9EPK6 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sil1Q9EPK6 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sil1Q9EPK6 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sil1Q9EPK6 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sil1Q9EPK6 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sil1Q9EPK6 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sil1Q9EPK6 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sil1Q9EPK6 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sil1Q9EPK6 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sil1Q9EPK6 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sil1Q9EPK6 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sil1Q9EPK6 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sil1Q9EPK6 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sil1Q9EPK6 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sil1Q9EPK6 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sil1Q9EPK6 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sil1Q9EPK6 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sil1Q9EPK6 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sil1Q9EPK6 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sil1Q9EPK6 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sil1Q9EPK6 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sil1Q9EPK6 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sil1Q9EPK6 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sil1Q9EPK6 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sil1Q9EPK6 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC18■□□□□ 0.47
Sil1Q9EPK6 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Sil1Q9EPK6 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Sil1Q9EPK6 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Sil1Q9EPK6 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Sil1Q9EPK6 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Sil1Q9EPK6 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Sil1Q9EPK6 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Sil1Q9EPK6 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Sil1Q9EPK6 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Sil1Q9EPK6 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sil1Q9EPK6 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sil1Q9EPK6 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sil1Q9EPK6 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sil1Q9EPK6 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sil1Q9EPK6 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sil1Q9EPK6 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sil1Q9EPK6 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sil1Q9EPK6 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sil1Q9EPK6 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sil1Q9EPK6 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Sil1Q9EPK6 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sil1Q9EPK6 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sil1Q9EPK6 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sil1Q9EPK6 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sil1Q9EPK6 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sil1Q9EPK6 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sil1Q9EPK6 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Sil1Q9EPK6 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sil1Q9EPK6 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sil1Q9EPK6 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sil1Q9EPK6 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sil1Q9EPK6 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sil1Q9EPK6 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sil1Q9EPK6 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sil1Q9EPK6 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sil1Q9EPK6 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sil1Q9EPK6 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sil1Q9EPK6 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sil1Q9EPK6 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Sil1Q9EPK6 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Sil1Q9EPK6 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sil1Q9EPK6 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sil1Q9EPK6 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sil1Q9EPK6 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sil1Q9EPK6 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sil1Q9EPK6 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sil1Q9EPK6 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sil1Q9EPK6 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sil1Q9EPK6 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sil1Q9EPK6 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Sil1Q9EPK6 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sil1Q9EPK6 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms