Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCG9

Trmt112, Multifunctional methyltransferase subunit TRM112-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trmt112Q9DCG9 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trmt112Q9DCG9 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trmt112Q9DCG9 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trmt112Q9DCG9 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trmt112Q9DCG9 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trmt112Q9DCG9 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trmt112Q9DCG9 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trmt112Q9DCG9 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trmt112Q9DCG9 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trmt112Q9DCG9 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trmt112Q9DCG9 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trmt112Q9DCG9 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trmt112Q9DCG9 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trmt112Q9DCG9 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trmt112Q9DCG9 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trmt112Q9DCG9 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trmt112Q9DCG9 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trmt112Q9DCG9 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trmt112Q9DCG9 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trmt112Q9DCG9 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trmt112Q9DCG9 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trmt112Q9DCG9 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trmt112Q9DCG9 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trmt112Q9DCG9 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trmt112Q9DCG9 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trmt112Q9DCG9 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trmt112Q9DCG9 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trmt112Q9DCG9 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trmt112Q9DCG9 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trmt112Q9DCG9 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trmt112Q9DCG9 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trmt112Q9DCG9 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trmt112Q9DCG9 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Trmt112Q9DCG9 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trmt112Q9DCG9 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trmt112Q9DCG9 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trmt112Q9DCG9 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Trmt112Q9DCG9 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trmt112Q9DCG9 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trmt112Q9DCG9 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Trmt112Q9DCG9 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trmt112Q9DCG9 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trmt112Q9DCG9 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trmt112Q9DCG9 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trmt112Q9DCG9 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trmt112Q9DCG9 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trmt112Q9DCG9 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trmt112Q9DCG9 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trmt112Q9DCG9 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trmt112Q9DCG9 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trmt112Q9DCG9 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trmt112Q9DCG9 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trmt112Q9DCG9 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trmt112Q9DCG9 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trmt112Q9DCG9 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Trmt112Q9DCG9 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Trmt112Q9DCG9 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Trmt112Q9DCG9 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Trmt112Q9DCG9 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Trmt112Q9DCG9 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Trmt112Q9DCG9 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Trmt112Q9DCG9 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Trmt112Q9DCG9 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Trmt112Q9DCG9 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Trmt112Q9DCG9 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Trmt112Q9DCG9 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Trmt112Q9DCG9 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Trmt112Q9DCG9 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Trmt112Q9DCG9 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Trmt112Q9DCG9 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Trmt112Q9DCG9 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Trmt112Q9DCG9 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Trmt112Q9DCG9 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Trmt112Q9DCG9 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Trmt112Q9DCG9 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Trmt112Q9DCG9 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Trmt112Q9DCG9 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Trmt112Q9DCG9 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Trmt112Q9DCG9 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Trmt112Q9DCG9 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trmt112Q9DCG9 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trmt112Q9DCG9 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trmt112Q9DCG9 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trmt112Q9DCG9 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trmt112Q9DCG9 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trmt112Q9DCG9 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trmt112Q9DCG9 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trmt112Q9DCG9 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trmt112Q9DCG9 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trmt112Q9DCG9 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trmt112Q9DCG9 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trmt112Q9DCG9 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trmt112Q9DCG9 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trmt112Q9DCG9 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trmt112Q9DCG9 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trmt112Q9DCG9 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trmt112Q9DCG9 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Trmt112Q9DCG9 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trmt112Q9DCG9 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Trmt112Q9DCG9 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms