Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC53

Cpne8, Copine-8, mousemouse

Predictions only

Length 577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne8Q9DC53 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Cpne8Q9DC53 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cpne8Q9DC53 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cpne8Q9DC53 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cpne8Q9DC53 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cpne8Q9DC53 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cpne8Q9DC53 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cpne8Q9DC53 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cpne8Q9DC53 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Cpne8Q9DC53 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cpne8Q9DC53 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cpne8Q9DC53 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cpne8Q9DC53 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cpne8Q9DC53 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cpne8Q9DC53 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cpne8Q9DC53 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cpne8Q9DC53 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cpne8Q9DC53 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cpne8Q9DC53 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cpne8Q9DC53 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cpne8Q9DC53 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cpne8Q9DC53 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cpne8Q9DC53 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cpne8Q9DC53 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cpne8Q9DC53 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cpne8Q9DC53 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cpne8Q9DC53 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cpne8Q9DC53 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cpne8Q9DC53 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cpne8Q9DC53 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cpne8Q9DC53 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cpne8Q9DC53 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cpne8Q9DC53 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cpne8Q9DC53 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cpne8Q9DC53 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cpne8Q9DC53 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cpne8Q9DC53 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cpne8Q9DC53 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cpne8Q9DC53 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cpne8Q9DC53 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Cpne8Q9DC53 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cpne8Q9DC53 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cpne8Q9DC53 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cpne8Q9DC53 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cpne8Q9DC53 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cpne8Q9DC53 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Cpne8Q9DC53 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cpne8Q9DC53 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cpne8Q9DC53 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cpne8Q9DC53 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Cpne8Q9DC53 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cpne8Q9DC53 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Cpne8Q9DC53 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
Cpne8Q9DC53 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cpne8Q9DC53 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cpne8Q9DC53 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cpne8Q9DC53 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Cpne8Q9DC53 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cpne8Q9DC53 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cpne8Q9DC53 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Cpne8Q9DC53 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cpne8Q9DC53 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cpne8Q9DC53 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cpne8Q9DC53 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cpne8Q9DC53 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cpne8Q9DC53 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cpne8Q9DC53 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cpne8Q9DC53 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cpne8Q9DC53 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cpne8Q9DC53 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cpne8Q9DC53 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cpne8Q9DC53 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cpne8Q9DC53 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cpne8Q9DC53 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cpne8Q9DC53 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cpne8Q9DC53 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cpne8Q9DC53 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cpne8Q9DC53 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Cpne8Q9DC53 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cpne8Q9DC53 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cpne8Q9DC53 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cpne8Q9DC53 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cpne8Q9DC53 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cpne8Q9DC53 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cpne8Q9DC53 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cpne8Q9DC53 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Cpne8Q9DC53 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Cpne8Q9DC53 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cpne8Q9DC53 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cpne8Q9DC53 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cpne8Q9DC53 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cpne8Q9DC53 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cpne8Q9DC53 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cpne8Q9DC53 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cpne8Q9DC53 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cpne8Q9DC53 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cpne8Q9DC53 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cpne8Q9DC53 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cpne8Q9DC53 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cpne8Q9DC53 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms