Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBY1

Syvn1, E3 ubiquitin-protein ligase synoviolin, mousemouse

Predictions only

Length 612 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syvn1Q9DBY1 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Syvn1Q9DBY1 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Syvn1Q9DBY1 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Syvn1Q9DBY1 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Syvn1Q9DBY1 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Syvn1Q9DBY1 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Syvn1Q9DBY1 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Syvn1Q9DBY1 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Syvn1Q9DBY1 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Syvn1Q9DBY1 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Syvn1Q9DBY1 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Syvn1Q9DBY1 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Syvn1Q9DBY1 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Syvn1Q9DBY1 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Syvn1Q9DBY1 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Syvn1Q9DBY1 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Syvn1Q9DBY1 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Syvn1Q9DBY1 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Syvn1Q9DBY1 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Syvn1Q9DBY1 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Syvn1Q9DBY1 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Syvn1Q9DBY1 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Syvn1Q9DBY1 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Syvn1Q9DBY1 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Syvn1Q9DBY1 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Syvn1Q9DBY1 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Syvn1Q9DBY1 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Syvn1Q9DBY1 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Syvn1Q9DBY1 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Syvn1Q9DBY1 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Syvn1Q9DBY1 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Syvn1Q9DBY1 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Syvn1Q9DBY1 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Syvn1Q9DBY1 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Syvn1Q9DBY1 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Syvn1Q9DBY1 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Syvn1Q9DBY1 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Syvn1Q9DBY1 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Syvn1Q9DBY1 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Syvn1Q9DBY1 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Syvn1Q9DBY1 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Syvn1Q9DBY1 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Syvn1Q9DBY1 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Syvn1Q9DBY1 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Syvn1Q9DBY1 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Syvn1Q9DBY1 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Syvn1Q9DBY1 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Syvn1Q9DBY1 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Syvn1Q9DBY1 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Syvn1Q9DBY1 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Syvn1Q9DBY1 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Syvn1Q9DBY1 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Syvn1Q9DBY1 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Syvn1Q9DBY1 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Syvn1Q9DBY1 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Syvn1Q9DBY1 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Syvn1Q9DBY1 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Syvn1Q9DBY1 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Syvn1Q9DBY1 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Syvn1Q9DBY1 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Syvn1Q9DBY1 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Syvn1Q9DBY1 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Syvn1Q9DBY1 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Syvn1Q9DBY1 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Syvn1Q9DBY1 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Syvn1Q9DBY1 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Syvn1Q9DBY1 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Syvn1Q9DBY1 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Syvn1Q9DBY1 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Syvn1Q9DBY1 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Syvn1Q9DBY1 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Syvn1Q9DBY1 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Syvn1Q9DBY1 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Syvn1Q9DBY1 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Syvn1Q9DBY1 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Syvn1Q9DBY1 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Syvn1Q9DBY1 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Syvn1Q9DBY1 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Syvn1Q9DBY1 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Syvn1Q9DBY1 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Syvn1Q9DBY1 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Syvn1Q9DBY1 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Syvn1Q9DBY1 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Syvn1Q9DBY1 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Syvn1Q9DBY1 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Syvn1Q9DBY1 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Syvn1Q9DBY1 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Syvn1Q9DBY1 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Syvn1Q9DBY1 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Syvn1Q9DBY1 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Syvn1Q9DBY1 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Syvn1Q9DBY1 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Syvn1Q9DBY1 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Syvn1Q9DBY1 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Syvn1Q9DBY1 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Syvn1Q9DBY1 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Syvn1Q9DBY1 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Syvn1Q9DBY1 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Syvn1Q9DBY1 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Syvn1Q9DBY1 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms