Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB70

Fundc1, FUN14 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 155 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fundc1Q9DB70 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fundc1Q9DB70 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fundc1Q9DB70 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Fundc1Q9DB70 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fundc1Q9DB70 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fundc1Q9DB70 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Fundc1Q9DB70 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Fundc1Q9DB70 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fundc1Q9DB70 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fundc1Q9DB70 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fundc1Q9DB70 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fundc1Q9DB70 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fundc1Q9DB70 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fundc1Q9DB70 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fundc1Q9DB70 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fundc1Q9DB70 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fundc1Q9DB70 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fundc1Q9DB70 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fundc1Q9DB70 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Fundc1Q9DB70 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Fundc1Q9DB70 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Fundc1Q9DB70 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
Fundc1Q9DB70 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Fundc1Q9DB70 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Fundc1Q9DB70 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Fundc1Q9DB70 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fundc1Q9DB70 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fundc1Q9DB70 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fundc1Q9DB70 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fundc1Q9DB70 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fundc1Q9DB70 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fundc1Q9DB70 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fundc1Q9DB70 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fundc1Q9DB70 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fundc1Q9DB70 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fundc1Q9DB70 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fundc1Q9DB70 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fundc1Q9DB70 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fundc1Q9DB70 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Fundc1Q9DB70 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fundc1Q9DB70 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fundc1Q9DB70 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fundc1Q9DB70 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fundc1Q9DB70 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fundc1Q9DB70 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fundc1Q9DB70 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fundc1Q9DB70 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fundc1Q9DB70 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fundc1Q9DB70 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fundc1Q9DB70 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fundc1Q9DB70 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fundc1Q9DB70 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fundc1Q9DB70 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fundc1Q9DB70 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Fundc1Q9DB70 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fundc1Q9DB70 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fundc1Q9DB70 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fundc1Q9DB70 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fundc1Q9DB70 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fundc1Q9DB70 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fundc1Q9DB70 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fundc1Q9DB70 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fundc1Q9DB70 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Fundc1Q9DB70 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fundc1Q9DB70 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fundc1Q9DB70 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fundc1Q9DB70 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Fundc1Q9DB70 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fundc1Q9DB70 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fundc1Q9DB70 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fundc1Q9DB70 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fundc1Q9DB70 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fundc1Q9DB70 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fundc1Q9DB70 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fundc1Q9DB70 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fundc1Q9DB70 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fundc1Q9DB70 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fundc1Q9DB70 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fundc1Q9DB70 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fundc1Q9DB70 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fundc1Q9DB70 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fundc1Q9DB70 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fundc1Q9DB70 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fundc1Q9DB70 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fundc1Q9DB70 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fundc1Q9DB70 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fundc1Q9DB70 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fundc1Q9DB70 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fundc1Q9DB70 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fundc1Q9DB70 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fundc1Q9DB70 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fundc1Q9DB70 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fundc1Q9DB70 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fundc1Q9DB70 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fundc1Q9DB70 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Fundc1Q9DB70 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fundc1Q9DB70 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fundc1Q9DB70 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Fundc1Q9DB70 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fundc1Q9DB70 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms