Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAW6

Prpf4, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 521 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf4Q9DAW6 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prpf4Q9DAW6 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prpf4Q9DAW6 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prpf4Q9DAW6 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prpf4Q9DAW6 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prpf4Q9DAW6 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prpf4Q9DAW6 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prpf4Q9DAW6 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prpf4Q9DAW6 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prpf4Q9DAW6 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prpf4Q9DAW6 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prpf4Q9DAW6 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prpf4Q9DAW6 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prpf4Q9DAW6 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prpf4Q9DAW6 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prpf4Q9DAW6 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prpf4Q9DAW6 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prpf4Q9DAW6 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prpf4Q9DAW6 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prpf4Q9DAW6 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prpf4Q9DAW6 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prpf4Q9DAW6 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prpf4Q9DAW6 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prpf4Q9DAW6 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prpf4Q9DAW6 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Prpf4Q9DAW6 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Prpf4Q9DAW6 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prpf4Q9DAW6 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prpf4Q9DAW6 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prpf4Q9DAW6 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prpf4Q9DAW6 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prpf4Q9DAW6 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prpf4Q9DAW6 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prpf4Q9DAW6 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Prpf4Q9DAW6 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prpf4Q9DAW6 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prpf4Q9DAW6 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prpf4Q9DAW6 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Prpf4Q9DAW6 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prpf4Q9DAW6 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prpf4Q9DAW6 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prpf4Q9DAW6 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prpf4Q9DAW6 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prpf4Q9DAW6 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prpf4Q9DAW6 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prpf4Q9DAW6 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prpf4Q9DAW6 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Prpf4Q9DAW6 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prpf4Q9DAW6 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Prpf4Q9DAW6 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prpf4Q9DAW6 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prpf4Q9DAW6 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prpf4Q9DAW6 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prpf4Q9DAW6 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prpf4Q9DAW6 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prpf4Q9DAW6 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prpf4Q9DAW6 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prpf4Q9DAW6 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prpf4Q9DAW6 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prpf4Q9DAW6 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prpf4Q9DAW6 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prpf4Q9DAW6 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prpf4Q9DAW6 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prpf4Q9DAW6 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prpf4Q9DAW6 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Prpf4Q9DAW6 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prpf4Q9DAW6 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prpf4Q9DAW6 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prpf4Q9DAW6 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Prpf4Q9DAW6 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Prpf4Q9DAW6 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Prpf4Q9DAW6 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Prpf4Q9DAW6 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prpf4Q9DAW6 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Prpf4Q9DAW6 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Prpf4Q9DAW6 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Prpf4Q9DAW6 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Prpf4Q9DAW6 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Prpf4Q9DAW6 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Prpf4Q9DAW6 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Prpf4Q9DAW6 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Prpf4Q9DAW6 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Prpf4Q9DAW6 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Prpf4Q9DAW6 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Prpf4Q9DAW6 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Prpf4Q9DAW6 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prpf4Q9DAW6 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prpf4Q9DAW6 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prpf4Q9DAW6 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prpf4Q9DAW6 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prpf4Q9DAW6 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Prpf4Q9DAW6 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Prpf4Q9DAW6 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prpf4Q9DAW6 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prpf4Q9DAW6 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prpf4Q9DAW6 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prpf4Q9DAW6 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prpf4Q9DAW6 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Prpf4Q9DAW6 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Prpf4Q9DAW6 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
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