Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA69

Ift43, Intraflagellar transport protein 43 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift43Q9DA69 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ift43Q9DA69 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ift43Q9DA69 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ift43Q9DA69 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ift43Q9DA69 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ift43Q9DA69 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ift43Q9DA69 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ift43Q9DA69 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ift43Q9DA69 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ift43Q9DA69 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ift43Q9DA69 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ift43Q9DA69 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ift43Q9DA69 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ift43Q9DA69 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ift43Q9DA69 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ift43Q9DA69 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ift43Q9DA69 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ift43Q9DA69 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ift43Q9DA69 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ift43Q9DA69 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ift43Q9DA69 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ift43Q9DA69 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ift43Q9DA69 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ift43Q9DA69 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ift43Q9DA69 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ift43Q9DA69 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ift43Q9DA69 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ift43Q9DA69 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ift43Q9DA69 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ift43Q9DA69 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ift43Q9DA69 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ift43Q9DA69 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ift43Q9DA69 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ift43Q9DA69 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ift43Q9DA69 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ift43Q9DA69 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ift43Q9DA69 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ift43Q9DA69 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ift43Q9DA69 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ift43Q9DA69 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ift43Q9DA69 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ift43Q9DA69 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ift43Q9DA69 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ift43Q9DA69 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ift43Q9DA69 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ift43Q9DA69 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ift43Q9DA69 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ift43Q9DA69 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ift43Q9DA69 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ift43Q9DA69 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ift43Q9DA69 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ift43Q9DA69 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ift43Q9DA69 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ift43Q9DA69 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ift43Q9DA69 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ift43Q9DA69 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ift43Q9DA69 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ift43Q9DA69 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ift43Q9DA69 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ift43Q9DA69 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ift43Q9DA69 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ift43Q9DA69 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ift43Q9DA69 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ift43Q9DA69 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ift43Q9DA69 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ift43Q9DA69 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ift43Q9DA69 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ift43Q9DA69 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ift43Q9DA69 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ift43Q9DA69 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ift43Q9DA69 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ift43Q9DA69 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ift43Q9DA69 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ift43Q9DA69 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ift43Q9DA69 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ift43Q9DA69 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ift43Q9DA69 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ift43Q9DA69 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ift43Q9DA69 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ift43Q9DA69 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ift43Q9DA69 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ift43Q9DA69 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ift43Q9DA69 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ift43Q9DA69 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ift43Q9DA69 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ift43Q9DA69 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ift43Q9DA69 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ift43Q9DA69 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ift43Q9DA69 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ift43Q9DA69 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ift43Q9DA69 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ift43Q9DA69 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ift43Q9DA69 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ift43Q9DA69 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ift43Q9DA69 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ift43Q9DA69 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ift43Q9DA69 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ift43Q9DA69 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ift43Q9DA69 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ift43Q9DA69 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms