Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA21

Smco2, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smco2Q9DA21 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Smco2Q9DA21 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Smco2Q9DA21 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Smco2Q9DA21 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Smco2Q9DA21 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Smco2Q9DA21 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Smco2Q9DA21 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Smco2Q9DA21 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Smco2Q9DA21 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Smco2Q9DA21 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Smco2Q9DA21 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Smco2Q9DA21 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Smco2Q9DA21 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Smco2Q9DA21 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Smco2Q9DA21 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Smco2Q9DA21 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Smco2Q9DA21 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Smco2Q9DA21 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Smco2Q9DA21 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Smco2Q9DA21 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Smco2Q9DA21 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Smco2Q9DA21 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Smco2Q9DA21 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Smco2Q9DA21 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Smco2Q9DA21 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Smco2Q9DA21 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Smco2Q9DA21 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Smco2Q9DA21 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Smco2Q9DA21 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Smco2Q9DA21 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Smco2Q9DA21 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Smco2Q9DA21 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Smco2Q9DA21 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Smco2Q9DA21 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Smco2Q9DA21 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Smco2Q9DA21 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Smco2Q9DA21 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Smco2Q9DA21 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Smco2Q9DA21 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Smco2Q9DA21 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Smco2Q9DA21 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Smco2Q9DA21 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Smco2Q9DA21 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Smco2Q9DA21 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Smco2Q9DA21 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Smco2Q9DA21 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Smco2Q9DA21 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Smco2Q9DA21 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Smco2Q9DA21 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Smco2Q9DA21 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Smco2Q9DA21 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Smco2Q9DA21 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Smco2Q9DA21 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Smco2Q9DA21 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Smco2Q9DA21 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Smco2Q9DA21 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Smco2Q9DA21 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Smco2Q9DA21 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Smco2Q9DA21 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Smco2Q9DA21 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Smco2Q9DA21 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Smco2Q9DA21 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Smco2Q9DA21 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Smco2Q9DA21 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Smco2Q9DA21 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Smco2Q9DA21 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Smco2Q9DA21 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Smco2Q9DA21 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Smco2Q9DA21 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Smco2Q9DA21 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Smco2Q9DA21 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Smco2Q9DA21 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Smco2Q9DA21 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Smco2Q9DA21 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Smco2Q9DA21 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Smco2Q9DA21 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Smco2Q9DA21 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Smco2Q9DA21 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Smco2Q9DA21 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Smco2Q9DA21 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Smco2Q9DA21 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Smco2Q9DA21 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Smco2Q9DA21 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Smco2Q9DA21 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Smco2Q9DA21 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Smco2Q9DA21 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Smco2Q9DA21 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Smco2Q9DA21 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Smco2Q9DA21 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Smco2Q9DA21 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Smco2Q9DA21 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Smco2Q9DA21 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Smco2Q9DA21 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Smco2Q9DA21 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Smco2Q9DA21 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Smco2Q9DA21 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Smco2Q9DA21 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Smco2Q9DA21 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Smco2Q9DA21 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Smco2Q9DA21 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms