Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA08

Sgf29, SAGA-associated factor 29, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgf29Q9DA08 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sgf29Q9DA08 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sgf29Q9DA08 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sgf29Q9DA08 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sgf29Q9DA08 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sgf29Q9DA08 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sgf29Q9DA08 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sgf29Q9DA08 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Sgf29Q9DA08 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sgf29Q9DA08 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sgf29Q9DA08 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sgf29Q9DA08 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sgf29Q9DA08 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sgf29Q9DA08 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sgf29Q9DA08 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sgf29Q9DA08 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sgf29Q9DA08 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sgf29Q9DA08 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sgf29Q9DA08 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sgf29Q9DA08 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sgf29Q9DA08 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sgf29Q9DA08 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sgf29Q9DA08 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sgf29Q9DA08 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sgf29Q9DA08 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sgf29Q9DA08 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sgf29Q9DA08 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sgf29Q9DA08 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sgf29Q9DA08 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sgf29Q9DA08 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sgf29Q9DA08 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sgf29Q9DA08 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sgf29Q9DA08 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sgf29Q9DA08 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sgf29Q9DA08 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sgf29Q9DA08 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sgf29Q9DA08 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sgf29Q9DA08 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sgf29Q9DA08 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sgf29Q9DA08 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Sgf29Q9DA08 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sgf29Q9DA08 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Sgf29Q9DA08 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Sgf29Q9DA08 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sgf29Q9DA08 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sgf29Q9DA08 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sgf29Q9DA08 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sgf29Q9DA08 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sgf29Q9DA08 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sgf29Q9DA08 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Sgf29Q9DA08 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sgf29Q9DA08 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sgf29Q9DA08 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sgf29Q9DA08 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sgf29Q9DA08 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sgf29Q9DA08 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Sgf29Q9DA08 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sgf29Q9DA08 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Sgf29Q9DA08 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sgf29Q9DA08 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sgf29Q9DA08 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sgf29Q9DA08 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sgf29Q9DA08 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sgf29Q9DA08 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sgf29Q9DA08 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sgf29Q9DA08 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sgf29Q9DA08 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sgf29Q9DA08 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sgf29Q9DA08 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sgf29Q9DA08 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sgf29Q9DA08 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sgf29Q9DA08 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sgf29Q9DA08 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sgf29Q9DA08 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sgf29Q9DA08 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sgf29Q9DA08 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sgf29Q9DA08 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sgf29Q9DA08 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sgf29Q9DA08 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Sgf29Q9DA08 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sgf29Q9DA08 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sgf29Q9DA08 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sgf29Q9DA08 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sgf29Q9DA08 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sgf29Q9DA08 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sgf29Q9DA08 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sgf29Q9DA08 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sgf29Q9DA08 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sgf29Q9DA08 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sgf29Q9DA08 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sgf29Q9DA08 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sgf29Q9DA08 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sgf29Q9DA08 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sgf29Q9DA08 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sgf29Q9DA08 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sgf29Q9DA08 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sgf29Q9DA08 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sgf29Q9DA08 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sgf29Q9DA08 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sgf29Q9DA08 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms