Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9Z7

Subh2bv, Histone H2B subacrosomal variant, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Subh2bvQ9D9Z7 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Subh2bvQ9D9Z7 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Subh2bvQ9D9Z7 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Subh2bvQ9D9Z7 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Subh2bvQ9D9Z7 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Subh2bvQ9D9Z7 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Subh2bvQ9D9Z7 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Subh2bvQ9D9Z7 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Subh2bvQ9D9Z7 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Subh2bvQ9D9Z7 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Subh2bvQ9D9Z7 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Subh2bvQ9D9Z7 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Subh2bvQ9D9Z7 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Subh2bvQ9D9Z7 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Subh2bvQ9D9Z7 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Subh2bvQ9D9Z7 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Subh2bvQ9D9Z7 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Subh2bvQ9D9Z7 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Subh2bvQ9D9Z7 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Subh2bvQ9D9Z7 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Subh2bvQ9D9Z7 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Subh2bvQ9D9Z7 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Subh2bvQ9D9Z7 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Subh2bvQ9D9Z7 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Subh2bvQ9D9Z7 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Subh2bvQ9D9Z7 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Subh2bvQ9D9Z7 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Subh2bvQ9D9Z7 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Subh2bvQ9D9Z7 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Subh2bvQ9D9Z7 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Subh2bvQ9D9Z7 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Subh2bvQ9D9Z7 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Subh2bvQ9D9Z7 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Subh2bvQ9D9Z7 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Subh2bvQ9D9Z7 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Subh2bvQ9D9Z7 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Subh2bvQ9D9Z7 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Subh2bvQ9D9Z7 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Subh2bvQ9D9Z7 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Subh2bvQ9D9Z7 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Subh2bvQ9D9Z7 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Subh2bvQ9D9Z7 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Subh2bvQ9D9Z7 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Subh2bvQ9D9Z7 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Subh2bvQ9D9Z7 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Subh2bvQ9D9Z7 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Subh2bvQ9D9Z7 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Subh2bvQ9D9Z7 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Subh2bvQ9D9Z7 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Subh2bvQ9D9Z7 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Subh2bvQ9D9Z7 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Subh2bvQ9D9Z7 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Subh2bvQ9D9Z7 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Subh2bvQ9D9Z7 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Subh2bvQ9D9Z7 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Subh2bvQ9D9Z7 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Subh2bvQ9D9Z7 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Subh2bvQ9D9Z7 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Subh2bvQ9D9Z7 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Subh2bvQ9D9Z7 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Subh2bvQ9D9Z7 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Subh2bvQ9D9Z7 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Subh2bvQ9D9Z7 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Subh2bvQ9D9Z7 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Subh2bvQ9D9Z7 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Subh2bvQ9D9Z7 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Subh2bvQ9D9Z7 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Subh2bvQ9D9Z7 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Subh2bvQ9D9Z7 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Subh2bvQ9D9Z7 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Subh2bvQ9D9Z7 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Subh2bvQ9D9Z7 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Subh2bvQ9D9Z7 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Subh2bvQ9D9Z7 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Subh2bvQ9D9Z7 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Subh2bvQ9D9Z7 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Subh2bvQ9D9Z7 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Subh2bvQ9D9Z7 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Subh2bvQ9D9Z7 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Subh2bvQ9D9Z7 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Subh2bvQ9D9Z7 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Subh2bvQ9D9Z7 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Subh2bvQ9D9Z7 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Subh2bvQ9D9Z7 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Subh2bvQ9D9Z7 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Subh2bvQ9D9Z7 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Subh2bvQ9D9Z7 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Subh2bvQ9D9Z7 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Subh2bvQ9D9Z7 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Subh2bvQ9D9Z7 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Subh2bvQ9D9Z7 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Subh2bvQ9D9Z7 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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