Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6J4

Necab3, N-terminal EF-hand calcium-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Necab3Q9D6J4 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Necab3Q9D6J4 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Necab3Q9D6J4 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Necab3Q9D6J4 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Necab3Q9D6J4 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Necab3Q9D6J4 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Necab3Q9D6J4 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Necab3Q9D6J4 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Necab3Q9D6J4 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Necab3Q9D6J4 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Necab3Q9D6J4 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Necab3Q9D6J4 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Necab3Q9D6J4 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Necab3Q9D6J4 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Necab3Q9D6J4 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Necab3Q9D6J4 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Necab3Q9D6J4 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Necab3Q9D6J4 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Necab3Q9D6J4 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Necab3Q9D6J4 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Necab3Q9D6J4 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Necab3Q9D6J4 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Necab3Q9D6J4 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Necab3Q9D6J4 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Necab3Q9D6J4 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Necab3Q9D6J4 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Necab3Q9D6J4 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Necab3Q9D6J4 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Necab3Q9D6J4 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Necab3Q9D6J4 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Necab3Q9D6J4 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Necab3Q9D6J4 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Necab3Q9D6J4 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Necab3Q9D6J4 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Necab3Q9D6J4 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Necab3Q9D6J4 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Necab3Q9D6J4 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Necab3Q9D6J4 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Necab3Q9D6J4 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Necab3Q9D6J4 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Necab3Q9D6J4 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Necab3Q9D6J4 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Necab3Q9D6J4 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Necab3Q9D6J4 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Necab3Q9D6J4 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Necab3Q9D6J4 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Necab3Q9D6J4 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Necab3Q9D6J4 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Necab3Q9D6J4 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Necab3Q9D6J4 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Necab3Q9D6J4 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Necab3Q9D6J4 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Necab3Q9D6J4 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Necab3Q9D6J4 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Necab3Q9D6J4 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Necab3Q9D6J4 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Necab3Q9D6J4 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Necab3Q9D6J4 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Necab3Q9D6J4 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Necab3Q9D6J4 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Necab3Q9D6J4 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Necab3Q9D6J4 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Necab3Q9D6J4 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Necab3Q9D6J4 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Necab3Q9D6J4 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Necab3Q9D6J4 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Necab3Q9D6J4 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Necab3Q9D6J4 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Necab3Q9D6J4 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Necab3Q9D6J4 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Necab3Q9D6J4 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Necab3Q9D6J4 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Necab3Q9D6J4 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Necab3Q9D6J4 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Necab3Q9D6J4 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Necab3Q9D6J4 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Necab3Q9D6J4 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Necab3Q9D6J4 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Necab3Q9D6J4 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Necab3Q9D6J4 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Necab3Q9D6J4 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Necab3Q9D6J4 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Necab3Q9D6J4 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Necab3Q9D6J4 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Necab3Q9D6J4 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Necab3Q9D6J4 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Necab3Q9D6J4 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Necab3Q9D6J4 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Necab3Q9D6J4 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Necab3Q9D6J4 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Necab3Q9D6J4 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Necab3Q9D6J4 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Necab3Q9D6J4 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Necab3Q9D6J4 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Necab3Q9D6J4 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Necab3Q9D6J4 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Necab3Q9D6J4 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Necab3Q9D6J4 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Necab3Q9D6J4 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Necab3Q9D6J4 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.7 ms