Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6J3

Ccdc94, Coiled-coil domain-containing protein 94, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc94Q9D6J3 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc94Q9D6J3 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc94Q9D6J3 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc94Q9D6J3 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc94Q9D6J3 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc94Q9D6J3 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc94Q9D6J3 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc94Q9D6J3 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc94Q9D6J3 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc94Q9D6J3 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc94Q9D6J3 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc94Q9D6J3 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc94Q9D6J3 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc94Q9D6J3 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc94Q9D6J3 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc94Q9D6J3 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc94Q9D6J3 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc94Q9D6J3 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc94Q9D6J3 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc94Q9D6J3 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc94Q9D6J3 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc94Q9D6J3 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc94Q9D6J3 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc94Q9D6J3 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc94Q9D6J3 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc94Q9D6J3 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc94Q9D6J3 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc94Q9D6J3 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc94Q9D6J3 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc94Q9D6J3 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc94Q9D6J3 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc94Q9D6J3 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc94Q9D6J3 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc94Q9D6J3 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc94Q9D6J3 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc94Q9D6J3 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc94Q9D6J3 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc94Q9D6J3 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc94Q9D6J3 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc94Q9D6J3 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc94Q9D6J3 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc94Q9D6J3 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc94Q9D6J3 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc94Q9D6J3 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc94Q9D6J3 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc94Q9D6J3 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc94Q9D6J3 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc94Q9D6J3 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc94Q9D6J3 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc94Q9D6J3 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc94Q9D6J3 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc94Q9D6J3 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc94Q9D6J3 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc94Q9D6J3 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc94Q9D6J3 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc94Q9D6J3 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc94Q9D6J3 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc94Q9D6J3 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc94Q9D6J3 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc94Q9D6J3 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc94Q9D6J3 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc94Q9D6J3 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc94Q9D6J3 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc94Q9D6J3 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc94Q9D6J3 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc94Q9D6J3 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc94Q9D6J3 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc94Q9D6J3 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc94Q9D6J3 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc94Q9D6J3 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc94Q9D6J3 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc94Q9D6J3 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc94Q9D6J3 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc94Q9D6J3 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc94Q9D6J3 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc94Q9D6J3 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc94Q9D6J3 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc94Q9D6J3 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc94Q9D6J3 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc94Q9D6J3 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc94Q9D6J3 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc94Q9D6J3 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc94Q9D6J3 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc94Q9D6J3 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc94Q9D6J3 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc94Q9D6J3 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc94Q9D6J3 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc94Q9D6J3 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc94Q9D6J3 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc94Q9D6J3 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc94Q9D6J3 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc94Q9D6J3 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc94Q9D6J3 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc94Q9D6J3 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc94Q9D6J3 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc94Q9D6J3 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc94Q9D6J3 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc94Q9D6J3 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc94Q9D6J3 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc94Q9D6J3 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms