Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6G9

Cmtm5, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmtm5Q9D6G9 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cmtm5Q9D6G9 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cmtm5Q9D6G9 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cmtm5Q9D6G9 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cmtm5Q9D6G9 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cmtm5Q9D6G9 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cmtm5Q9D6G9 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cmtm5Q9D6G9 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cmtm5Q9D6G9 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cmtm5Q9D6G9 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cmtm5Q9D6G9 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Cmtm5Q9D6G9 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cmtm5Q9D6G9 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cmtm5Q9D6G9 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cmtm5Q9D6G9 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cmtm5Q9D6G9 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cmtm5Q9D6G9 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cmtm5Q9D6G9 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cmtm5Q9D6G9 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cmtm5Q9D6G9 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cmtm5Q9D6G9 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cmtm5Q9D6G9 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cmtm5Q9D6G9 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cmtm5Q9D6G9 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cmtm5Q9D6G9 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cmtm5Q9D6G9 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cmtm5Q9D6G9 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cmtm5Q9D6G9 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cmtm5Q9D6G9 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cmtm5Q9D6G9 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cmtm5Q9D6G9 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cmtm5Q9D6G9 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cmtm5Q9D6G9 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cmtm5Q9D6G9 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cmtm5Q9D6G9 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Cmtm5Q9D6G9 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cmtm5Q9D6G9 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cmtm5Q9D6G9 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cmtm5Q9D6G9 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cmtm5Q9D6G9 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cmtm5Q9D6G9 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cmtm5Q9D6G9 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cmtm5Q9D6G9 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cmtm5Q9D6G9 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cmtm5Q9D6G9 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cmtm5Q9D6G9 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cmtm5Q9D6G9 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cmtm5Q9D6G9 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cmtm5Q9D6G9 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cmtm5Q9D6G9 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cmtm5Q9D6G9 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cmtm5Q9D6G9 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cmtm5Q9D6G9 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cmtm5Q9D6G9 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cmtm5Q9D6G9 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cmtm5Q9D6G9 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cmtm5Q9D6G9 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cmtm5Q9D6G9 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cmtm5Q9D6G9 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cmtm5Q9D6G9 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cmtm5Q9D6G9 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Cmtm5Q9D6G9 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Cmtm5Q9D6G9 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Cmtm5Q9D6G9 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cmtm5Q9D6G9 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cmtm5Q9D6G9 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cmtm5Q9D6G9 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cmtm5Q9D6G9 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cmtm5Q9D6G9 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cmtm5Q9D6G9 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cmtm5Q9D6G9 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cmtm5Q9D6G9 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cmtm5Q9D6G9 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cmtm5Q9D6G9 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cmtm5Q9D6G9 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cmtm5Q9D6G9 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cmtm5Q9D6G9 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cmtm5Q9D6G9 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cmtm5Q9D6G9 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cmtm5Q9D6G9 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cmtm5Q9D6G9 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cmtm5Q9D6G9 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cmtm5Q9D6G9 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cmtm5Q9D6G9 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cmtm5Q9D6G9 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cmtm5Q9D6G9 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cmtm5Q9D6G9 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cmtm5Q9D6G9 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cmtm5Q9D6G9 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cmtm5Q9D6G9 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cmtm5Q9D6G9 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Cmtm5Q9D6G9 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cmtm5Q9D6G9 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cmtm5Q9D6G9 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cmtm5Q9D6G9 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cmtm5Q9D6G9 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cmtm5Q9D6G9 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cmtm5Q9D6G9 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cmtm5Q9D6G9 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cmtm5Q9D6G9 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms