Protein–RNA interactions for Protein: Q9D548

Zcchc13, Cellular nucleic acid binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc13Q9D548 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Zcchc13Q9D548 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Zcchc13Q9D548 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Zcchc13Q9D548 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Zcchc13Q9D548 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Zcchc13Q9D548 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Zcchc13Q9D548 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Zcchc13Q9D548 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Zcchc13Q9D548 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Zcchc13Q9D548 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Zcchc13Q9D548 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Zcchc13Q9D548 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Zcchc13Q9D548 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Zcchc13Q9D548 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Zcchc13Q9D548 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Zcchc13Q9D548 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Zcchc13Q9D548 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Zcchc13Q9D548 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Zcchc13Q9D548 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Zcchc13Q9D548 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Zcchc13Q9D548 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Zcchc13Q9D548 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Zcchc13Q9D548 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Zcchc13Q9D548 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Zcchc13Q9D548 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Zcchc13Q9D548 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Zcchc13Q9D548 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Zcchc13Q9D548 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Zcchc13Q9D548 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Zcchc13Q9D548 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Zcchc13Q9D548 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Zcchc13Q9D548 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Zcchc13Q9D548 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Zcchc13Q9D548 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Zcchc13Q9D548 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Zcchc13Q9D548 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Zcchc13Q9D548 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Zcchc13Q9D548 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Zcchc13Q9D548 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Zcchc13Q9D548 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Zcchc13Q9D548 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Zcchc13Q9D548 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Zcchc13Q9D548 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Zcchc13Q9D548 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Zcchc13Q9D548 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Zcchc13Q9D548 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Zcchc13Q9D548 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Zcchc13Q9D548 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Zcchc13Q9D548 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Zcchc13Q9D548 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Zcchc13Q9D548 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Zcchc13Q9D548 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Zcchc13Q9D548 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Zcchc13Q9D548 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Zcchc13Q9D548 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Zcchc13Q9D548 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Zcchc13Q9D548 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Zcchc13Q9D548 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Zcchc13Q9D548 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Zcchc13Q9D548 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Zcchc13Q9D548 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Zcchc13Q9D548 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Zcchc13Q9D548 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Zcchc13Q9D548 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Zcchc13Q9D548 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Zcchc13Q9D548 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Zcchc13Q9D548 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Zcchc13Q9D548 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Zcchc13Q9D548 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Zcchc13Q9D548 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Zcchc13Q9D548 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Zcchc13Q9D548 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Zcchc13Q9D548 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Zcchc13Q9D548 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Zcchc13Q9D548 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Zcchc13Q9D548 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Zcchc13Q9D548 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Zcchc13Q9D548 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Zcchc13Q9D548 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Zcchc13Q9D548 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Zcchc13Q9D548 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Zcchc13Q9D548 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Zcchc13Q9D548 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Zcchc13Q9D548 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Zcchc13Q9D548 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Zcchc13Q9D548 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Zcchc13Q9D548 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Zcchc13Q9D548 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Zcchc13Q9D548 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Zcchc13Q9D548 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Zcchc13Q9D548 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Zcchc13Q9D548 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Zcchc13Q9D548 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Zcchc13Q9D548 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Zcchc13Q9D548 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Zcchc13Q9D548 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Zcchc13Q9D548 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Zcchc13Q9D548 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Zcchc13Q9D548 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Zcchc13Q9D548 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms