Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4V3

Ccdc83, Coiled-coil domain-containing protein 83, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc83Q9D4V3 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc83Q9D4V3 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc83Q9D4V3 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc83Q9D4V3 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc83Q9D4V3 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc83Q9D4V3 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc83Q9D4V3 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc83Q9D4V3 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc83Q9D4V3 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc83Q9D4V3 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc83Q9D4V3 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc83Q9D4V3 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc83Q9D4V3 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc83Q9D4V3 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc83Q9D4V3 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc83Q9D4V3 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc83Q9D4V3 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc83Q9D4V3 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc83Q9D4V3 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc83Q9D4V3 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc83Q9D4V3 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc83Q9D4V3 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc83Q9D4V3 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc83Q9D4V3 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc83Q9D4V3 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc83Q9D4V3 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc83Q9D4V3 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccdc83Q9D4V3 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccdc83Q9D4V3 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccdc83Q9D4V3 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccdc83Q9D4V3 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccdc83Q9D4V3 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccdc83Q9D4V3 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc83Q9D4V3 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc83Q9D4V3 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc83Q9D4V3 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc83Q9D4V3 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc83Q9D4V3 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc83Q9D4V3 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc83Q9D4V3 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc83Q9D4V3 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc83Q9D4V3 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc83Q9D4V3 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc83Q9D4V3 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc83Q9D4V3 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc83Q9D4V3 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc83Q9D4V3 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc83Q9D4V3 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc83Q9D4V3 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc83Q9D4V3 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc83Q9D4V3 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc83Q9D4V3 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc83Q9D4V3 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc83Q9D4V3 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc83Q9D4V3 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc83Q9D4V3 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc83Q9D4V3 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc83Q9D4V3 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc83Q9D4V3 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc83Q9D4V3 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc83Q9D4V3 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc83Q9D4V3 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc83Q9D4V3 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc83Q9D4V3 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc83Q9D4V3 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc83Q9D4V3 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc83Q9D4V3 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc83Q9D4V3 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc83Q9D4V3 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc83Q9D4V3 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc83Q9D4V3 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc83Q9D4V3 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc83Q9D4V3 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc83Q9D4V3 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc83Q9D4V3 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc83Q9D4V3 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc83Q9D4V3 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc83Q9D4V3 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc83Q9D4V3 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc83Q9D4V3 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc83Q9D4V3 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc83Q9D4V3 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc83Q9D4V3 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc83Q9D4V3 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc83Q9D4V3 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc83Q9D4V3 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc83Q9D4V3 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc83Q9D4V3 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc83Q9D4V3 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc83Q9D4V3 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc83Q9D4V3 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc83Q9D4V3 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc83Q9D4V3 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc83Q9D4V3 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc83Q9D4V3 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc83Q9D4V3 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc83Q9D4V3 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc83Q9D4V3 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc83Q9D4V3 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc83Q9D4V3 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms